14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0094 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0094  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  267  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0682  hypothetical protein  84.33 
 
 
134 aa  214  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0121  hypothetical protein  82.84 
 
 
134 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3800  hypothetical protein  48.78 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4048  hypothetical protein  47.97 
 
 
155 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551805  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1661  hypothetical protein  47.97 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2930  hypothetical protein  43.38 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2950  hypothetical protein  47.15 
 
 
151 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0765  hypothetical protein  47.11 
 
 
133 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4643  hypothetical protein  41.04 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0846  hypothetical protein  42.28 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1842  hypothetical protein  36.07 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1943  hypothetical protein  37.5 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3625  hypothetical protein  35.48 
 
 
269 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.330686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>