14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3625 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3625  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.330686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1842  hypothetical protein  56.99 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1943  hypothetical protein  44.26 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2930  hypothetical protein  43.65 
 
 		 136 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3800  hypothetical protein  37.1 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4048  hypothetical protein  36.29 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0094  hypothetical protein  35.48 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1661  hypothetical protein  37.9 
 
 		 154 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0682  hypothetical protein  37.1 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0121  hypothetical protein  38.4 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4643  hypothetical protein  37.59 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0765  hypothetical protein  37.88 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0846  hypothetical protein  31.5 
 
 		 133 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2950  hypothetical protein  32.52 
 
 		 151 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>