14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1842 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1842  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  560  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3625  hypothetical protein  56.99 
 
 		 269 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.330686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1943  hypothetical protein  44.75 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3800  hypothetical protein  35.94 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0094  hypothetical protein  36.07 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4048  hypothetical protein  35.16 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1661  hypothetical protein  37.5 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2930  hypothetical protein  37.1 
 
 		 136 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0682  hypothetical protein  34.65 
 
 		 134 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4643  hypothetical protein  37.59 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0121  hypothetical protein  36.89 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2950  hypothetical protein  36.89 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0765  hypothetical protein  34.85 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0846  hypothetical protein  34.38 
 
 		 133 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>