14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0121 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0121  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  263  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0682  hypothetical protein  92.54 
 
 		 134 aa  234  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0094  hypothetical protein  82.84 
 
 		 134 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3800  hypothetical protein  47.15 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4048  hypothetical protein  44.72 
 
 		 155 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2930  hypothetical protein  45.59 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1661  hypothetical protein  44.72 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2950  hypothetical protein  48.78 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0765  hypothetical protein  43.55 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4643  hypothetical protein  39.55 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0846  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3625  hypothetical protein  38.4 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.330686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1842  hypothetical protein  36.89 
 
 		 289 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1943  hypothetical protein  35.83 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>