14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2950 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_2950  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  298  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3800  hypothetical protein  60 
 
 
155 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4048  hypothetical protein  59.35 
 
 
155 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551805  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1661  hypothetical protein  59.09 
 
 
154 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0846  hypothetical protein  58.78 
 
 
133 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2930  hypothetical protein  53.6 
 
 
136 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0765  hypothetical protein  53.38 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4643  hypothetical protein  55.47 
 
 
134 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0094  hypothetical protein  47.15 
 
 
134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0682  hypothetical protein  48.78 
 
 
134 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0121  hypothetical protein  48.78 
 
 
134 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1842  hypothetical protein  36.89 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1943  hypothetical protein  39.17 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3625  hypothetical protein  32.52 
 
 
269 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.330686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>