14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4048 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4048  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  309  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3800  hypothetical protein  93.55 
 
 		 155 aa  292  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1661  hypothetical protein  81.29 
 
 		 154 aa  239  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2950  hypothetical protein  59.35 
 
 		 151 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0765  hypothetical protein  52.63 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0846  hypothetical protein  54.92 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2930  hypothetical protein  50.4 
 
 		 136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4643  hypothetical protein  54.55 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0094  hypothetical protein  47.97 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0682  hypothetical protein  44.72 
 
 		 134 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0121  hypothetical protein  44.72 
 
 		 134 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1943  hypothetical protein  39.67 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1842  hypothetical protein  35.16 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3625  hypothetical protein  36.29 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.330686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>