14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3800 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3800  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  306  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4048  hypothetical protein  93.55 
 
 		 155 aa  292  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1661  hypothetical protein  81.94 
 
 		 154 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2950  hypothetical protein  60 
 
 		 151 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0765  hypothetical protein  53.38 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0846  hypothetical protein  55.74 
 
 		 133 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0094  hypothetical protein  48.78 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4643  hypothetical protein  55.37 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2930  hypothetical protein  50.4 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0682  hypothetical protein  47.15 
 
 		 134 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0121  hypothetical protein  47.15 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1943  hypothetical protein  40.5 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1842  hypothetical protein  35.94 
 
 		 289 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3625  hypothetical protein  37.1 
 
 		 269 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.330686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>