14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0765 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_0765  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  261  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4643  hypothetical protein  91.04 
 
 
134 aa  222  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0846  hypothetical protein  70.9 
 
 
133 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4048  hypothetical protein  52.63 
 
 
155 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551805  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3800  hypothetical protein  53.38 
 
 
155 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1661  hypothetical protein  53.38 
 
 
154 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2950  hypothetical protein  53.38 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0094  hypothetical protein  46.34 
 
 
134 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2930  hypothetical protein  45.45 
 
 
136 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0682  hypothetical protein  44.09 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0121  hypothetical protein  42.52 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3625  hypothetical protein  37.88 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.330686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1842  hypothetical protein  34.85 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1943  hypothetical protein  37.78 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>