236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3110 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0058  Phosphoenolpyruvate carboxylase  54.18 
 
 		 910 aa  875    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.424552 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2967  phosphoenolpyruvate carboxylase  82.71 
 
 		 910 aa  1514    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000103268 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0577  Phosphoenolpyruvate carboxylase  50.99 
 
 		 922 aa  896    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.222337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3110  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 908 aa  1827    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150886 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0683  Phosphoenolpyruvate carboxylase  51.3 
 
 		 922 aa  899    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.781097  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1629  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.13 
 
 		 923 aa  844    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0209  Phosphoenolpyruvate carboxylase  51.32 
 
 		 912 aa  847    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00083066 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2855  phosphoenolpyruvate carboxylase  45.51 
 
 		 922 aa  801    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2974  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.26 
 
 		 914 aa  854    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0559  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.95 
 
 		 922 aa  914    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0808  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.24 
 
 		 908 aa  914    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0226  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.64 
 
 		 911 aa  852    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.695017  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0606  Phosphoenolpyruvate carboxylase  51.9 
 
 		 922 aa  922    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3664  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.23 
 
 		 916 aa  485  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387741  normal  0.313845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7118  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.77 
 
 		 920 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6558  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.17 
 
 		 920 aa  478  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.985726  normal  0.0731651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1753  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.56 
 
 		 922 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0935488  normal  0.649239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1718  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.5 
 
 		 919 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.333688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1801  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.2 
 
 		 922 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.369049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2137  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.31 
 
 		 922 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.24789 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3255  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.11 
 
 		 920 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5925  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.92 
 
 		 946 aa  432  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613814  normal  0.197386 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.37 
 
 		 906 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.14 
 
 		 929 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.14 
 
 		 929 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.73 
 
 		 896 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.94 
 
 		 946 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.94 
 
 		 946 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.94 
 
 		 946 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.93 
 
 		 939 aa  386  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.67 
 
 		 947 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.91 
 
 		 923 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.36 
 
 		 938 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.74 
 
 		 937 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.46 
 
 		 933 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.22 
 
 		 929 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.8 
 
 		 920 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.38 
 
 		 936 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.86 
 
 		 929 aa  375  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.08 
 
 		 928 aa  376  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.38 
 
 		 936 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.01 
 
 		 928 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.22 
 
 		 931 aa  371  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.04 
 
 		 929 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1653  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.52 
 
 		 892 aa  372  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0256628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.35 
 
 		 933 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.7 
 
 		 934 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.48 
 
 		 945 aa  363  5.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.55 
 
 		 947 aa  362  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.68 
 
 		 933 aa  361  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.63 
 
 		 929 aa  361  4e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.96 
 
 		 946 aa  358  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.52 
 
 		 950 aa  358  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.74 
 
 		 918 aa  357  5e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0628  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.15 
 
 		 903 aa  357  5e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472091  normal  0.156419 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.53 
 
 		 932 aa  356  1e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.63 
 
 		 949 aa  356  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.88 
 
 		 926 aa  355  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.85 
 
 		 949 aa  354  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.52 
 
 		 949 aa  353  5.9999999999999994e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.26 
 
 		 1001 aa  353  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.07 
 
 		 957 aa  353  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0707  Phosphoenolpyruvate carboxylase  30.41 
 
 		 884 aa  352  1e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.57 
 
 		 951 aa  352  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.98 
 
 		 921 aa  352  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.44 
 
 		 926 aa  350  6e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.91 
 
 		 900 aa  350  6e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.22 
 
 		 985 aa  349  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0759  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.63 
 
 		 931 aa  348  2e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.77 
 
 		 1002 aa  348  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.94 
 
 		 892 aa  347  5e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.7 
 
 		 994 aa  347  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3135  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.79 
 
 		 929 aa  346  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365231  normal  0.570221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0841  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.06 
 
 		 939 aa  346  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3081  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.97 
 
 		 889 aa  346  1e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.134099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.48 
 
 		 930 aa  345  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.61 
 
 		 1075 aa  345  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.4 
 
 		 982 aa  344  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.5 
 
 		 1004 aa  343  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.29 
 
 		 1030 aa  343  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.79 
 
 		 972 aa  343  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.36 
 
 		 926 aa  342  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.3 
 
 		 938 aa  342  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.06 
 
 		 994 aa  341  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0760  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.68 
 
 		 940 aa  341  4e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.06 
 
 		 1009 aa  341  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.94 
 
 		 998 aa  341  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.94 
 
 		 998 aa  340  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.06 
 
 		 1009 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.07 
 
 		 1008 aa  340  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.89 
 
 		 1088 aa  340  8e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.26 
 
 		 970 aa  339  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.53 
 
 		 952 aa  338  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.14 
 
 		 914 aa  338  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.33 
 
 		 896 aa  337  5e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.26 
 
 		 954 aa  337  5e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.89 
 
 		 1023 aa  337  7.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.96 
 
 		 1009 aa  336  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.18 
 
 		 898 aa  336  1e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  33 
 
 		 994 aa  336  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>