243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2137 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2137  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 922 aa  1865    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.24789 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1718  Phosphoenolpyruvate carboxylase  61.32 
 
 		 919 aa  1075    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.333688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6558  phosphoenolpyruvate carboxylase  76.12 
 
 		 920 aa  1353    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.985726  normal  0.0731651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5925  phosphoenolpyruvate carboxylase  58.42 
 
 		 946 aa  993    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613814  normal  0.197386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7118  phosphoenolpyruvate carboxylase  77.21 
 
 		 920 aa  1394    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3255  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.99 
 
 		 920 aa  929    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1753  Phosphoenolpyruvate carboxylase  97.07 
 
 		 922 aa  1799    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0935488  normal  0.649239 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3664  phosphoenolpyruvate carboxylase  81.24 
 
 		 916 aa  1485    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387741  normal  0.313845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1801  phosphoenolpyruvate carboxylase  99.78 
 
 		 922 aa  1862    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.369049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0058  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.37 
 
 		 910 aa  514  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.424552 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0577  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.79 
 
 		 922 aa  512  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.222337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0559  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.92 
 
 		 922 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.24 
 
 		 929 aa  503  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0683  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.82 
 
 		 922 aa  501  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.781097  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2855  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.41 
 
 		 922 aa  500  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2967  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.83 
 
 		 910 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000103268 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1629  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.52 
 
 		 923 aa  491  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0808  phosphoenolpyruvate carboxylase  37 
 
 		 908 aa  489  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2974  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.37 
 
 		 914 aa  491  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0226  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.25 
 
 		 911 aa  487  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.695017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0209  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.23 
 
 		 912 aa  482  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00083066 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0606  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36 
 
 		 922 aa  481  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3110  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.31 
 
 		 908 aa  479  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150886 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.74 
 
 		 906 aa  476  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.92 
 
 		 939 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.38 
 
 		 933 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.04 
 
 		 957 aa  464  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.74 
 
 		 952 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.76 
 
 		 933 aa  458  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.77 
 
 		 929 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.73 
 
 		 938 aa  459  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.77 
 
 		 929 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.46 
 
 		 926 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.85 
 
 		 931 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.38 
 
 		 933 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.5 
 
 		 928 aa  450  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.14 
 
 		 946 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.62 
 
 		 928 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.41 
 
 		 938 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.81 
 
 		 929 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.39 
 
 		 929 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.42 
 
 		 936 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.33 
 
 		 1002 aa  445  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.66 
 
 		 985 aa  445  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.6 
 
 		 1001 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.56 
 
 		 929 aa  440  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.64 
 
 		 937 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.24 
 
 		 947 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.46 
 
 		 949 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.06 
 
 		 949 aa  440  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.84 
 
 		 1030 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.35 
 
 		 949 aa  439  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.09 
 
 		 994 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3469  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.48 
 
 		 1024 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.55 
 
 		 1009 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.71 
 
 		 923 aa  436  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2647  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.48 
 
 		 1024 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.261414  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.3 
 
 		 1002 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.48 
 
 		 989 aa  432  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.98 
 
 		 994 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.59 
 
 		 1006 aa  429  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.36 
 
 		 1023 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.46 
 
 		 995 aa  429  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.94 
 
 		 1075 aa  428  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.45 
 
 		 930 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.69 
 
 		 989 aa  428  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.08 
 
 		 920 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.61 
 
 		 1017 aa  424  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.05 
 
 		 994 aa  426  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.92 
 
 		 932 aa  426  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.73 
 
 		 946 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.6 
 
 		 950 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.73 
 
 		 946 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.73 
 
 		 946 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.11 
 
 		 947 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.16 
 
 		 970 aa  422  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.63 
 
 		 900 aa  420  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.52 
 
 		 951 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17621  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.68 
 
 		 989 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.59 
 
 		 989 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.99 
 
 		 938 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.83 
 
 		 1004 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.41 
 
 		 945 aa  418  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.73 
 
 		 982 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.92 
 
 		 934 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.84 
 
 		 926 aa  415  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16951  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.33 
 
 		 1007 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.05 
 
 		 994 aa  412  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.84 
 
 		 918 aa  412  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.83 
 
 		 1085 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.79 
 
 		 1088 aa  412  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1696  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.2 
 
 		 1017 aa  412  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3806  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.58 
 
 		 907 aa  409  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.589788  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.21 
 
 		 1021 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.73 
 
 		 936 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.05 
 
 		 994 aa  412  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.05 
 
 		 994 aa  412  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.05 
 
 		 994 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.05 
 
 		 1024 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.05 
 
 		 994 aa  412  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>