241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1753 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2137  Phosphoenolpyruvate carboxylase  97.07 
 
 		 922 aa  1800    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.24789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1753  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 922 aa  1869    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0935488  normal  0.649239 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3664  phosphoenolpyruvate carboxylase  80.8 
 
 		 916 aa  1482    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387741  normal  0.313845 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5925  phosphoenolpyruvate carboxylase  58.2 
 
 		 946 aa  991    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613814  normal  0.197386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7118  phosphoenolpyruvate carboxylase  77.32 
 
 		 920 aa  1390    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3255  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.99 
 
 		 920 aa  930    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1718  Phosphoenolpyruvate carboxylase  61.1 
 
 		 919 aa  1075    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.333688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6558  phosphoenolpyruvate carboxylase  76.01 
 
 		 920 aa  1350    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.985726  normal  0.0731651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1801  phosphoenolpyruvate carboxylase  97.07 
 
 		 922 aa  1800    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.369049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0058  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.36 
 
 		 910 aa  514  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.424552 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0577  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.41 
 
 		 922 aa  510  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.222337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0559  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.84 
 
 		 922 aa  505  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.01 
 
 		 929 aa  501  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2855  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.41 
 
 		 922 aa  500  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2974  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.54 
 
 		 914 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0683  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.71 
 
 		 922 aa  496  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.781097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2967  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.83 
 
 		 910 aa  499  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000103268 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0808  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.12 
 
 		 908 aa  491  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0226  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.06 
 
 		 911 aa  488  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.695017  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1629  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.4 
 
 		 923 aa  486  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3110  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.56 
 
 		 908 aa  485  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0209  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.04 
 
 		 912 aa  482  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00083066 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0606  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.2 
 
 		 922 aa  480  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.66 
 
 		 906 aa  474  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.38 
 
 		 933 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.99 
 
 		 939 aa  465  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.22 
 
 		 957 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.74 
 
 		 952 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.57 
 
 		 933 aa  457  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.19 
 
 		 931 aa  456  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.73 
 
 		 938 aa  459  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.89 
 
 		 929 aa  456  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.89 
 
 		 929 aa  456  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.49 
 
 		 933 aa  456  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.73 
 
 		 928 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.09 
 
 		 928 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.52 
 
 		 938 aa  449  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.69 
 
 		 926 aa  449  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.14 
 
 		 946 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.54 
 
 		 985 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.54 
 
 		 936 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.7 
 
 		 929 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.05 
 
 		 923 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.71 
 
 		 1001 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.33 
 
 		 1002 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.67 
 
 		 929 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.86 
 
 		 937 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.39 
 
 		 929 aa  442  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.7 
 
 		 947 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.57 
 
 		 949 aa  439  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.61 
 
 		 949 aa  438  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.5 
 
 		 949 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.66 
 
 		 1030 aa  435  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.44 
 
 		 989 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3469  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.17 
 
 		 1024 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.67 
 
 		 1009 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2647  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.17 
 
 		 1024 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.261414  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.9 
 
 		 1002 aa  432  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.55 
 
 		 994 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.55 
 
 		 994 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.85 
 
 		 946 aa  429  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.16 
 
 		 950 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.94 
 
 		 1075 aa  429  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.26 
 
 		 932 aa  429  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.85 
 
 		 946 aa  429  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.48 
 
 		 989 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.85 
 
 		 946 aa  429  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.99 
 
 		 945 aa  424  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.48 
 
 		 1006 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.29 
 
 		 995 aa  425  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.93 
 
 		 947 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.53 
 
 		 970 aa  425  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.95 
 
 		 900 aa  424  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.45 
 
 		 994 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.19 
 
 		 920 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.41 
 
 		 930 aa  422  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.68 
 
 		 1023 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.1 
 
 		 1017 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.07 
 
 		 926 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.94 
 
 		 982 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17621  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.33 
 
 		 989 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.56 
 
 		 934 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.37 
 
 		 989 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.88 
 
 		 938 aa  415  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.44 
 
 		 951 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.08 
 
 		 937 aa  415  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.33 
 
 		 932 aa  410  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.94 
 
 		 1004 aa  412  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3806  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.96 
 
 		 907 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.589788  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.15 
 
 		 936 aa  412  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.01 
 
 		 994 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  32 
 
 		 926 aa  409  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.52 
 
 		 1008 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.22 
 
 		 1018 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.01 
 
 		 994 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.01 
 
 		 994 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.01 
 
 		 994 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.01 
 
 		 1024 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.01 
 
 		 994 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16951  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.37 
 
 		 1007 aa  409  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>