44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2629 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0675    86.06 
 
 		 876 bp  696    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2629    100 
 
 		 823 bp  1631    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  84.5 
 
 		 826 bp  577  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  84.34 
 
 		 826 bp  565  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  84 
 
 		 825 bp  557  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  84.13 
 
 		 826 bp  553  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  84.09 
 
 		 826 bp  549  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  84.01 
 
 		 826 bp  545  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  83.9 
 
 		 826 bp  543  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  83.85 
 
 		 826 bp  533  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2051    83.6 
 
 		 827 bp  529  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  83.66 
 
 		 826 bp  527  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4423    83.25 
 
 		 818 bp  507  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.227705  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4297    84.03 
 
 		 825 bp  484  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  82.8 
 
 		 814 bp  466  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1437    82.27 
 
 		 808 bp  434  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1220    88.1 
 
 		 1955 bp  345  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000904356  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0694    87.93 
 
 		 395 bp  345  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4369    89.44 
 
 		 287 bp  313  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0407016  normal  0.373385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0895    85.23 
 
 		 366 bp  210  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000120526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0891    81.62 
 
 		 807 bp  178  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000765218  unclonable  0.0000148237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0636    86.18 
 
 		 135 bp  109  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00239894  normal  0.243236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0102    91.03 
 
 		 244 bp  99.6  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000409194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4370    91.38 
 
 		 135 bp  75.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0256562  normal  0.563616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1425    82.12 
 
 		 159 bp  63.9  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 801 bp  58  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 801 bp  58  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 801 bp  58  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 801 bp  58  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 801 bp  58  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 801 bp  58  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 801 bp  58  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5115    100 
 
 		 3897 bp  58  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 801 bp  58  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 801 bp  58  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 801 bp  58  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 801 bp  58  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 801 bp  58  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0604    100 
 
 		 1752 bp  58  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 801 bp  58  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 801 bp  58  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4035    84.21 
 
 		 135 bp  56  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0627552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0890    83.91 
 
 		 159 bp  54  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.023767  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1933    88 
 
 		 348 bp  52  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>