68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1220 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2390  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.082083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1383  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000158375  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1437    92.43 
 
 		 808 bp  676    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1477  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136224  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  99.59 
 
 		 826 bp  955    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  93.46 
 
 		 826 bp  716    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  93.46 
 
 		 826 bp  716    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1873  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00916179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2051    94.29 
 
 		 827 bp  749    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  94.29 
 
 		 826 bp  749    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2345  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0101  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000553926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3274  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000259909  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3381    99.91 
 
 		 3271 bp  2228    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00173664  hitchhiker  0.0095813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3382  transposase, IS4 family protein  99.91 
 
 		 1058 bp  2089    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182437  hitchhiker  0.00538438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3389  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141638  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  92.02 
 
 		 826 bp  660    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3833  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4033  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000656142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  98.57 
 
 		 826 bp  916    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4083  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0538175  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4095  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00617588  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1221  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000020949  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1220    100 
 
 		 1955 bp  3875    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000904356  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0156    100 
 
 		 1819 bp  2236    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00432374  normal  0.387266 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0157  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00114927  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  93.05 
 
 		 826 bp  700    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0834  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000820934  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0247  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186858  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0751  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000459793  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0302  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0539  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0478326  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0635  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1058 bp  2097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000109907  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4297    92.39 
 
 		 825 bp  626  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  91.51 
 
 		 825 bp  609  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  91.3 
 
 		 826 bp  609  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  89.98 
 
 		 814 bp  581  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4423    89.8 
 
 		 818 bp  581  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.227705  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0694    94.22 
 
 		 395 bp  494  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0443    94.37 
 
 		 1708 bp  464  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000207672  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0445  hypothetical protein  89.33 
 
 		 462 bp  458  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000109917  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0675    92.22 
 
 		 876 bp  456  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0891    87.21 
 
 		 807 bp  412  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000765218  unclonable  0.0000148237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4369    92.98 
 
 		 287 bp  398  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0407016  normal  0.373385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1933    89.28 
 
 		 348 bp  391  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2629    88.1 
 
 		 823 bp  345  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0895    88.93 
 
 		 366 bp  329  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000120526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4370    90.48 
 
 		 135 bp  155  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0256562  normal  0.563616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0890    91.59 
 
 		 159 bp  141  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.023767  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1425    88.89 
 
 		 159 bp  99.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0102    87.5 
 
 		 244 bp  79.8  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000409194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5115    96.67 
 
 		 3897 bp  52  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0604    96.67 
 
 		 1752 bp  52  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0636    85.71 
 
 		 135 bp  48.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00239894  normal  0.243236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>