42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4297 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  88.74 
 
 		 826 bp  892    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4423    86.32 
 
 		 818 bp  739    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.227705  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4297    100 
 
 		 825 bp  1635    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  89.95 
 
 		 826 bp  971    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  90.79 
 
 		 825 bp  1033    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  90.44 
 
 		 826 bp  1003    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  88.86 
 
 		 826 bp  900    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  88.62 
 
 		 826 bp  884    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2051    87.17 
 
 		 827 bp  789    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  89.23 
 
 		 826 bp  924    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  88.86 
 
 		 826 bp  900    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1437    86.56 
 
 		 808 bp  745    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  90.19 
 
 		 826 bp  987    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0675    89.7 
 
 		 876 bp  827    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  86.56 
 
 		 814 bp  753    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1220    92.39 
 
 		 1955 bp  626  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000904356  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0891    85.69 
 
 		 807 bp  577  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000765218  unclonable  0.0000148237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2629    84.03 
 
 		 823 bp  484  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1933    91.01 
 
 		 348 bp  438  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0694    89.58 
 
 		 395 bp  436  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4369    92.25 
 
 		 287 bp  381  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0407016  normal  0.373385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0895    87.58 
 
 		 366 bp  289  5.999999999999999e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000120526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4370    88.1 
 
 		 135 bp  131  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0256562  normal  0.563616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0890    88.79 
 
 		 159 bp  117  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.023767  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1425    87.64 
 
 		 159 bp  89.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0102    92.06 
 
 		 244 bp  85.7  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000409194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 		 801 bp  50.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 		 801 bp  50.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5115    96.55 
 
 		 3897 bp  50.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 		 801 bp  50.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 		 801 bp  50.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 		 801 bp  50.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 		 801 bp  50.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 		 801 bp  50.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 		 801 bp  50.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 		 801 bp  50.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 		 801 bp  50.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 		 801 bp  50.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 		 801 bp  50.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0604    96.55 
 
 		 1752 bp  50.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 		 801 bp  50.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 		 801 bp  50.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.167479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>