29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1437 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  87.89 
 
 		 826 bp  841    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4423    89.26 
 
 		 818 bp  928    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.227705  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4297    86.56 
 
 		 825 bp  745    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  90.35 
 
 		 826 bp  993    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  87.3 
 
 		 825 bp  787    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  87.42 
 
 		 826 bp  803    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  87.41 
 
 		 826 bp  809    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  89.59 
 
 		 826 bp  952    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2051    89.06 
 
 		 827 bp  922    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  89.23 
 
 		 826 bp  928    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  88.86 
 
 		 826 bp  904    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  90.48 
 
 		 826 bp  1001    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1437    100 
 
 		 808 bp  1602    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  88.85 
 
 		 814 bp  878    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1220    92.43 
 
 		 1955 bp  676    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000904356  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0675    85.2 
 
 		 876 bp  638    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0891    84.33 
 
 		 807 bp  563  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000765218  unclonable  0.0000148237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2629    82.27 
 
 		 823 bp  434  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1933    87.83 
 
 		 348 bp  351  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0895    88.59 
 
 		 366 bp  321  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000120526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0694    84.99 
 
 		 395 bp  315  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4369    83.1 
 
 		 287 bp  170  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0407016  normal  0.373385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0102    87.5 
 
 		 244 bp  143  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000409194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0890    90.74 
 
 		 159 bp  135  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.023767  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4370    86.51 
 
 		 135 bp  115  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0256562  normal  0.563616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1425    84.93 
 
 		 159 bp  101  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0636    92.31 
 
 		 135 bp  71.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00239894  normal  0.243236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4035    90.74 
 
 		 135 bp  67.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0627552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2804  cobalamin biosynthesis protein CobD  100 
 
 		 1095 bp  50.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584343  normal  0.747096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>