21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1425 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1425    100 
 
 		 159 bp  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0675    93.33 
 
 		 876 bp  131  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0895    92.22 
 
 		 366 bp  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000120526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1437    84.93 
 
 		 808 bp  101  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1220    88.89 
 
 		 1955 bp  99.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000904356  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  92.65 
 
 		 826 bp  95.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0891    94.92 
 
 		 807 bp  93.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000765218  unclonable  0.0000148237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  87.78 
 
 		 826 bp  91.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  87.64 
 
 		 825 bp  89.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4297    87.64 
 
 		 825 bp  89.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  86.67 
 
 		 826 bp  83.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  86.52 
 
 		 826 bp  81.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  89.71 
 
 		 826 bp  79.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2051    90.62 
 
 		 827 bp  79.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  89.83 
 
 		 826 bp  69.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  85.19 
 
 		 814 bp  65.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1933    87.5 
 
 		 348 bp  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2629    82.12 
 
 		 823 bp  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  86.76 
 
 		 826 bp  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  85.94 
 
 		 826 bp  56  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4423    85.94 
 
 		 818 bp  56  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.227705  normal  0.282412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>