26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0891 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0891    100 
 
 		 807 bp  1600    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000765218  unclonable  0.0000148237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  86.71 
 
 		 814 bp  731    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  85.94 
 
 		 826 bp  597  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  85.8 
 
 		 826 bp  589  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4297    85.69 
 
 		 825 bp  577  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  85.27 
 
 		 826 bp  567  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  85.37 
 
 		 826 bp  565  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1437    84.33 
 
 		 808 bp  563  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  84.99 
 
 		 826 bp  551  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  84.9 
 
 		 826 bp  543  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  84.94 
 
 		 826 bp  541  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2051    84.81 
 
 		 827 bp  535  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  84.68 
 
 		 825 bp  521  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  84.51 
 
 		 826 bp  517  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4423    83.36 
 
 		 818 bp  460  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.227705  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0675    83.48 
 
 		 876 bp  458  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1220    87.21 
 
 		 1955 bp  412  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000904356  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0694    89.34 
 
 		 395 bp  303  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1933    86.67 
 
 		 348 bp  291  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0895    84.67 
 
 		 366 bp  216  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000120526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2629    81.62 
 
 		 823 bp  178  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4369    87.5 
 
 		 287 bp  127  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0407016  normal  0.373385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4370    88.03 
 
 		 135 bp  121  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0256562  normal  0.563616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1425    94.92 
 
 		 159 bp  93.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0102    85.84 
 
 		 244 bp  89.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000409194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0890    86 
 
 		 159 bp  87.7  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.023767  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>