42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2051 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  90.68 
 
 		 826 bp  1017    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4423    91.81 
 
 		 818 bp  1102    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.227705  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4297    87.17 
 
 		 825 bp  789    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  94.22 
 
 		 826 bp  1255    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  88.92 
 
 		 825 bp  908    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  88.92 
 
 		 826 bp  916    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  90.07 
 
 		 826 bp  977    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  91.04 
 
 		 826 bp  1041    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2051    100 
 
 		 827 bp  1639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  90.19 
 
 		 826 bp  985    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  90.07 
 
 		 826 bp  977    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1437    89.06 
 
 		 808 bp  922    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  94.82 
 
 		 826 bp  1294    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0675    87.1 
 
 		 876 bp  771    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1220    94.29 
 
 		 1955 bp  749    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000904356  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  88.15 
 
 		 814 bp  874    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0891    84.81 
 
 		 807 bp  535  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000765218  unclonable  0.0000148237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2629    83.6 
 
 		 823 bp  529  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0694    90.7 
 
 		 395 bp  474  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1933    87.54 
 
 		 348 bp  343  5e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4369    90.07 
 
 		 287 bp  331  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0407016  normal  0.373385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0895    85.91 
 
 		 366 bp  258  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000120526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0890    92.59 
 
 		 159 bp  151  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.023767  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4370    86.51 
 
 		 135 bp  115  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0256562  normal  0.563616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0102    88.61 
 
 		 244 bp  85.7  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000409194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1425    90.62 
 
 		 159 bp  79.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5115    96.67 
 
 		 3897 bp  52  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0604    96.67 
 
 		 1752 bp  52  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  96.67 
 
 		 801 bp  52  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.167479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>