21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4369 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4369    100 
 
 		 287 bp  569  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0407016  normal  0.373385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0675    94.04 
 
 		 876 bp  422  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  93.31 
 
 		 826 bp  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1220    92.98 
 
 		 1955 bp  398  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000904356  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  92.98 
 
 		 826 bp  398  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  92.98 
 
 		 825 bp  398  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  92.98 
 
 		 826 bp  398  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  92.63 
 
 		 826 bp  391  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  92.25 
 
 		 826 bp  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4423    92.28 
 
 		 818 bp  383  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.227705  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4297    92.25 
 
 		 825 bp  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  92.25 
 
 		 826 bp  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  92.25 
 
 		 826 bp  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  91.9 
 
 		 826 bp  373  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2051    90.07 
 
 		 827 bp  331  6e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0694    89.79 
 
 		 395 bp  317  9e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2629    89.44 
 
 		 823 bp  313  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  87.23 
 
 		 814 bp  270  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1437    83.1 
 
 		 808 bp  170  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0891    87.5 
 
 		 807 bp  127  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000765218  unclonable  0.0000148237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0102    88.75 
 
 		 244 bp  87.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000409194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>