23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0895 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0895    100 
 
 		 366 bp  726    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000120526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1220    88.93 
 
 		 1955 bp  329  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000904356  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1437    88.59 
 
 		 808 bp  321  7.999999999999999e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  88.26 
 
 		 826 bp  313  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  87.92 
 
 		 826 bp  305  5.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  87.92 
 
 		 826 bp  305  5.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0675    88.22 
 
 		 876 bp  303  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  87.58 
 
 		 826 bp  297  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4297    87.58 
 
 		 825 bp  289  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  87.25 
 
 		 826 bp  289  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  86.24 
 
 		 826 bp  266  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  85.91 
 
 		 826 bp  258  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  86.24 
 
 		 825 bp  258  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2051    85.91 
 
 		 827 bp  258  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  85.71 
 
 		 826 bp  250  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  84.35 
 
 		 814 bp  218  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0891    84.67 
 
 		 807 bp  216  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000765218  unclonable  0.0000148237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2629    85.23 
 
 		 823 bp  210  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4423    83.56 
 
 		 818 bp  208  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.227705  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1933    85.58 
 
 		 348 bp  174  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1425    92.22 
 
 		 159 bp  123  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0890    86 
 
 		 159 bp  87.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.023767  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4650  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase family protein  96.43 
 
 		 2202 bp  48.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>