19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0636 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0636    100 
 
 		 135 bp  268  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00239894  normal  0.243236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2629    86.18 
 
 		 823 bp  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0675    87.91 
 
 		 876 bp  93.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  92.31 
 
 		 826 bp  71.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1437    92.31 
 
 		 808 bp  71.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  92.31 
 
 		 826 bp  71.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  92.31 
 
 		 826 bp  71.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  92.16 
 
 		 826 bp  69.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  92.16 
 
 		 826 bp  69.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4423    90.7 
 
 		 818 bp  54  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.227705  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4035    90.7 
 
 		 135 bp  54  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0627552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 825 bp  54  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  96.67 
 
 		 826 bp  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  96.67 
 
 		 814 bp  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  85.71 
 
 		 826 bp  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  85.71 
 
 		 826 bp  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4370    100 
 
 		 135 bp  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0256562  normal  0.563616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1220    85.71 
 
 		 1955 bp  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000904356  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2051    85.45 
 
 		 827 bp  46.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>