65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3850 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3850  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  100 
 
 		 293 aa  591  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.386494 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5411  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  59.59 
 
 		 289 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398056  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5450  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  59.59 
 
 		 289 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488662 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4819  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  59.59 
 
 		 289 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0201  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  58.62 
 
 		 288 aa  331  9e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5449  hypothetical protein  55.4 
 
 		 166 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5002  hypothetical protein  53.47 
 
 		 160 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  49.59 
 
 		 464 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03637  Potential redox protein  39.69 
 
 		 131 aa  97.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223227  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07021  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000970  cell division inhibitor  35.38 
 
 		 128 aa  86.3  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1860  hypothetical protein  36.23 
 
 		 163 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147247  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4062  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.04 
 
 		 141 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0170887  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04441  hypothetical protein  35.4 
 
 		 130 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.141762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3164  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.43 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0517  hypothetical protein  31.82 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2894  hypothetical protein  34.72 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000016603  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0931  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.16 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1941  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.93 
 
 		 147 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0206301 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1482  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.05 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.469356 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.59 
 
 		 162 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15765  normal  0.357312 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0771  hypothetical protein  35.77 
 
 		 129 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1409  hypothetical protein  35.43 
 
 		 139 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3684  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.01 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.316801  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0610  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.01 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3338  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.59 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0420  hypothetical protein  32.74 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.600155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3626  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.01 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.95092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0615  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.28 
 
 		 129 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.72548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3218  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.22 
 
 		 132 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00144282  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3508  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.45 
 
 		 129 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04751  hypothetical protein  31.86 
 
 		 130 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.154576  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3808  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.22 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0344386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2020  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.52 
 
 		 137 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2511  hypothetical protein  34.92 
 
 		 137 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3208  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.52 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346323  normal  0.0537298 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04851  hypothetical protein  30.09 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2108  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.13 
 
 		 136 aa  65.1  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310466  normal  0.354164 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1687  hypothetical protein  34.65 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1605  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.17 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15521  hypothetical protein  31.25 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0675  hypothetical protein  34.23 
 
 		 135 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.916492  normal  0.175959 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11891  hypothetical protein  32.29 
 
 		 134 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.811967  normal  0.0619225 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0715  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0353  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.2 
 
 		 122 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0236  hypothetical protein  32.33 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.368645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2144  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.17 
 
 		 128 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.04 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.411404  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07171  hypothetical protein  30.63 
 
 		 145 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0568  hypothetical protein  29.55 
 
 		 142 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0181  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.93 
 
 		 140 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1814  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.37 
 
 		 170 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0121  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.76 
 
 		 137 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1838  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.89 
 
 		 160 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2077  hypothetical protein  29.09 
 
 		 138 aa  52.8  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.949648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5381  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.919604  normal  0.706787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0767  hypothetical protein  38.83 
 
 		 139 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10574  predicted protein  26.36 
 
 		 129 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1840  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.06 
 
 		 170 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2743  hypothetical protein  28.1 
 
 		 124 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590114  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6771  hypothetical protein  27.93 
 
 		 124 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1272  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.73 
 
 		 125 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1922  hypothetical protein  20.18 
 
 		 125 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0171  hypothetical protein  30.47 
 
 		 142 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.304239 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2979  hypothetical protein  29.57 
 
 		 125 aa  42.7  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00993093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>