63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0771 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0771  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3508  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  89.15 
 
 		 129 aa  251  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0615  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  88.37 
 
 		 129 aa  249  6e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.72548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3338  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  88.37 
 
 		 129 aa  248  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3218  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  84.38 
 
 		 132 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00144282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3626  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  83.59 
 
 		 132 aa  230  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.95092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0610  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  83.59 
 
 		 132 aa  229  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3684  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  82.03 
 
 		 132 aa  227  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.316801  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3808  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  82.03 
 
 		 132 aa  226  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0344386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3164  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  59.35 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2108  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  53.97 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310466  normal  0.354164 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000970  cell division inhibitor  53.17 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07021  hypothetical protein  51.22 
 
 		 128 aa  129  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0931  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  47.93 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4062  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.64 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0170887  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03637  Potential redox protein  47.93 
 
 		 131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223227  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1409  hypothetical protein  46.03 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0517  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  103  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0201  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.71 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04441  hypothetical protein  34.92 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.141762  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04751  hypothetical protein  34.13 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.154576  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3850  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.77 
 
 		 293 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.386494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.54 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.411404  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0420  hypothetical protein  32.54 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.600155  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1482  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.55 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.469356 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1941  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.65 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0206301 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0675  hypothetical protein  34.92 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.916492  normal  0.175959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1860  hypothetical protein  30.36 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147247  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11891  hypothetical protein  29.92 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.811967  normal  0.0619225 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5450  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.05 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5411  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.05 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398056  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4819  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.05 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04851  hypothetical protein  30.16 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2020  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.23 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2894  hypothetical protein  27.91 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000016603  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2511  hypothetical protein  29.51 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3208  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.69 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346323  normal  0.0537298 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15521  hypothetical protein  28.36 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0715  hypothetical protein  28.36 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1687  hypothetical protein  32.54 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.36 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15765  normal  0.357312 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2077  hypothetical protein  29.23 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.949648 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10574  predicted protein  28.32 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1605  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.32 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0568  hypothetical protein  28.03 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6771  hypothetical protein  32.11 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1814  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.23 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2144  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.36 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0767  hypothetical protein  29.51 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1838  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.44 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0121  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.35 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07171  hypothetical protein  26.98 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0353  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.22 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1922  hypothetical protein  21.1 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1840  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.81 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0303  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.33 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0904  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.33 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2979  hypothetical protein  27.43 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00993093  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2743  hypothetical protein  28.57 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2536  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.43 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1272  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.93 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1929  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.73 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0436  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.23 
 
 		 131 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>