63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0715 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0715  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  273  4e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15521  hypothetical protein  96.24 
 
 
137 aa  268  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0675  hypothetical protein  49.61 
 
 
135 aa  152  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.916492  normal  0.175959 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2077  hypothetical protein  48 
 
 
138 aa  149  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.949648 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11891  hypothetical protein  52 
 
 
134 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.811967  normal  0.0619225 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07171  hypothetical protein  47.11 
 
 
145 aa  140  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1687  hypothetical protein  48.03 
 
 
134 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1840  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  47.24 
 
 
170 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1814  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  46.46 
 
 
170 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04441  hypothetical protein  42.74 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.141762  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0420  hypothetical protein  44.35 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.600155  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04751  hypothetical protein  45.16 
 
 
130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.154576  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04851  hypothetical protein  45.97 
 
 
130 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1838  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  40 
 
 
160 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10574  predicted protein  40.32 
 
 
129 aa  105  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.48 
 
 
162 aa  97.4  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15765  normal  0.357312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1941  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.04 
 
 
147 aa  89.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0206301 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1482  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.17 
 
 
170 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.469356 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03637  Potential redox protein  33.63 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223227  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1605  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.15 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000970  cell division inhibitor  32.54 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07021  hypothetical protein  31.75 
 
 
128 aa  77  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1860  hypothetical protein  30 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147247  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4062  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.33 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0170887  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0767  hypothetical protein  28.23 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3164  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.46 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2144  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.11 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5381  hypothetical protein  29.75 
 
 
133 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.919604  normal  0.706787 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1409  hypothetical protein  27.27 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0517  hypothetical protein  33.93 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0771  hypothetical protein  28.36 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3850  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.57 
 
 
293 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.386494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0201  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.79 
 
 
288 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2020  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.19 
 
 
137 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3684  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.41 
 
 
132 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.316801  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1929  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.21 
 
 
126 aa  59.3  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3626  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.41 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.95092  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0904  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.72 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0610  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.41 
 
 
132 aa  59.3  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3218  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.82 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00144282  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2894  hypothetical protein  28.68 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000016603  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2108  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.13 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310466  normal  0.354164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2511  hypothetical protein  26.55 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768135  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3208  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.55 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346323  normal  0.0537298 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3508  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.56 
 
 
129 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281099  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2743  hypothetical protein  35.53 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590114  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3338  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.56 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0615  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.56 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.72548  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3808  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.73 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0344386  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32698  predicted protein  25.66 
 
 
770 aa  55.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.782214  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0236  hypothetical protein  28.36 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.368645  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0931  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.63 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1272  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  24.56 
 
 
141 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.411404  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4819  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.95 
 
 
289 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5450  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.95 
 
 
289 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5411  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.95 
 
 
289 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0121  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.97 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0181  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.07 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385017  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0568  hypothetical protein  23.31 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2979  hypothetical protein  25.62 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00993093  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6771  hypothetical protein  26.42 
 
 
124 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667149  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0303  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  23.61 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>