63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1838 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1838  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  100 
 
 
160 aa  333  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1814  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  65.49 
 
 
170 aa  209  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1840  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  66.19 
 
 
170 aa  204  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2077  hypothetical protein  56.49 
 
 
138 aa  155  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.949648 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10574  predicted protein  44.53 
 
 
129 aa  133  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0675  hypothetical protein  49.6 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.916492  normal  0.175959 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11891  hypothetical protein  46.92 
 
 
134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.811967  normal  0.0619225 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1687  hypothetical protein  46.4 
 
 
134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0715  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15521  hypothetical protein  42.4 
 
 
137 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07171  hypothetical protein  44.19 
 
 
145 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04851  hypothetical protein  39.84 
 
 
130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  44.92 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15765  normal  0.357312 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04751  hypothetical protein  35.94 
 
 
130 aa  104  6e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.154576  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04441  hypothetical protein  36.8 
 
 
130 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.141762  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0420  hypothetical protein  37.29 
 
 
130 aa  101  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.600155  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1482  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.93 
 
 
170 aa  86.3  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.469356 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32698  predicted protein  34.88 
 
 
770 aa  85.1  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.782214  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1941  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.39 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0206301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03637  Potential redox protein  33.64 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223227  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000970  cell division inhibitor  29.2 
 
 
128 aa  67  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4062  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.77 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0170887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1860  hypothetical protein  30.77 
 
 
163 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2144  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.01 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5381  hypothetical protein  33.59 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.919604  normal  0.706787 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0201  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.78 
 
 
288 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07021  hypothetical protein  25.66 
 
 
128 aa  60.5  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0121  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.08 
 
 
137 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4819  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.71 
 
 
289 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5450  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.71 
 
 
289 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5411  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.71 
 
 
289 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398056  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1409  hypothetical protein  23.64 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1605  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.25 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0236  hypothetical protein  27.66 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.368645  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0767  hypothetical protein  29.46 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0181  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.33 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385017  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2894  hypothetical protein  29.58 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000016603  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0931  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.12 
 
 
130 aa  54.7  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3164  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.66 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2020  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.31 
 
 
137 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.68 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.411404  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3850  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.89 
 
 
293 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.386494 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0568  hypothetical protein  24.83 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0517  hypothetical protein  25 
 
 
136 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0904  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.43 
 
 
128 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3508  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.95 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281099  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2511  hypothetical protein  30.3 
 
 
137 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768135  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2743  hypothetical protein  25.42 
 
 
124 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590114  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3208  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.69 
 
 
137 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346323  normal  0.0537298 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0610  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  23.68 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2979  hypothetical protein  29.75 
 
 
125 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00993093  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3626  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  23.68 
 
 
132 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.95092  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3684  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  22.81 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.316801  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3338  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.19 
 
 
129 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0771  hypothetical protein  25.44 
 
 
129 aa  47.4  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0615  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.19 
 
 
129 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.72548  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3218  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  23.89 
 
 
132 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00144282  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1929  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.71 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2108  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  23.4 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310466  normal  0.354164 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3808  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  21.93 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0344386  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0521  hypothetical protein  26.02 
 
 
125 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.39093 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0303  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.19 
 
 
125 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1272  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.18 
 
 
125 aa  41.6  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>