56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2108 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2108  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  100 
 
 		 136 aa  287  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310466  normal  0.354164 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3164  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  58.27 
 
 		 129 aa  157  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3626  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  57.03 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.95092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3684  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  57.03 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.316801  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0610  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  57.03 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3218  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  56.25 
 
 		 132 aa  146  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00144282  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3338  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  55.56 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0615  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  55.56 
 
 		 129 aa  143  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.72548  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0771  hypothetical protein  53.97 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3808  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  54.69 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0344386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3508  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  53.97 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0931  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  51.64 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0517  hypothetical protein  49.61 
 
 		 136 aa  130  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000970  cell division inhibitor  50.4 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1409  hypothetical protein  47.24 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07021  hypothetical protein  49.21 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4062  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.06 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0170887  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03637  Potential redox protein  47.01 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223227  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1860  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2894  hypothetical protein  28.26 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000016603  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04751  hypothetical protein  36.04 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.154576  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0420  hypothetical protein  36.04 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.600155  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1687  hypothetical protein  36.7 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0675  hypothetical protein  32.03 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.916492  normal  0.175959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2020  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.3 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04441  hypothetical protein  34.23 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.141762  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04851  hypothetical protein  34.43 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4819  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.5 
 
 		 289 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5450  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.5 
 
 		 289 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5411  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.5 
 
 		 289 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398056  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3208  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.53 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346323  normal  0.0537298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2511  hypothetical protein  30.53 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3850  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.92 
 
 		 293 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.386494 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1941  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.03 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0206301 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1482  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.17 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.469356 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0201  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.26 
 
 		 288 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0767  hypothetical protein  29.17 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2077  hypothetical protein  28.24 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.949648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.98 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15765  normal  0.357312 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07171  hypothetical protein  30.63 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15521  hypothetical protein  29.13 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0715  hypothetical protein  29.13 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11891  hypothetical protein  30.63 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.811967  normal  0.0619225 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2144  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.06 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.61 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.411404  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10574  predicted protein  30 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0121  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.41 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1605  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.43 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1814  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.57 
 
 		 170 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0568  hypothetical protein  25.93 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5381  hypothetical protein  27.93 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.919604  normal  0.706787 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0303  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.8 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1838  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  23.4 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1840  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.83 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1929  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.72 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2743  hypothetical protein  31.19 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>