47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1272 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1272  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  100 
 
 		 125 aa  255  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0904  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  49.53 
 
 		 128 aa  96.7  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1929  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  41.27 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5381  hypothetical protein  41.28 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.919604  normal  0.706787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0767  hypothetical protein  44.34 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0353  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.71 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0521  hypothetical protein  31.25 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.39093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.71 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15765  normal  0.357312 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2624  hypothetical protein  33.87 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.718341  normal  0.010851 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15521  hypothetical protein  30 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0715  hypothetical protein  30 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2979  hypothetical protein  30.58 
 
 		 125 aa  52  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00993093  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0201  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.48 
 
 		 288 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1922  hypothetical protein  23.53 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2077  hypothetical protein  31.18 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.949648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0121  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.08 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4062  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.46 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0170887  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07021  hypothetical protein  28.24 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0236  hypothetical protein  32.41 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.368645  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2743  hypothetical protein  34.21 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0181  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.06 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2144  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.03 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3164  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.09 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11891  hypothetical protein  25.93 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.811967  normal  0.0619225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6771  hypothetical protein  33.03 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2511  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0568  hypothetical protein  32.71 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3850  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.73 
 
 		 293 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.386494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3208  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.77 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346323  normal  0.0537298 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000970  cell division inhibitor  27.34 
 
 		 128 aa  43.5  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0303  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.1 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2020  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.63 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1409  hypothetical protein  27.27 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03637  Potential redox protein  25.6 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223227  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1941  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.97 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0206301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0931  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.42 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3218  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.62 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00144282  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1482  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.36 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.469356 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0420  hypothetical protein  25 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.600155  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1840  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.1 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04751  hypothetical protein  26.97 
 
 		 130 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.154576  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07171  hypothetical protein  29.9 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1838  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.18 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2136  hypothetical protein  24.11 
 
 		 636 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.810683  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0771  hypothetical protein  28.93 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04441  hypothetical protein  25.84 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.141762  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04851  hypothetical protein  25 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>