64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4062 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_4062  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  100 
 
 
141 aa  300  6.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0170887  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03637  Potential redox protein  56.8 
 
 
131 aa  153  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223227  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000970  cell division inhibitor  45.45 
 
 
128 aa  117  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0931  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  44.26 
 
 
130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07021  hypothetical protein  41.6 
 
 
128 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3626  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  43.18 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.95092  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3684  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.42 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.316801  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3218  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  43.18 
 
 
132 aa  110  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00144282  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0610  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.42 
 
 
132 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3508  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  44.19 
 
 
129 aa  110  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281099  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0771  hypothetical protein  42.64 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3808  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  43.61 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0344386  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3338  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  43.41 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0615  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  43.41 
 
 
129 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.72548  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3164  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  44.35 
 
 
129 aa  104  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2108  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.06 
 
 
136 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310466  normal  0.354164 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1482  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.86 
 
 
170 aa  87  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.469356 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0201  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.11 
 
 
288 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3850  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.04 
 
 
293 aa  80.5  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.386494 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0517  hypothetical protein  35.4 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1860  hypothetical protein  30.77 
 
 
163 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147247  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1409  hypothetical protein  34.45 
 
 
139 aa  77  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2077  hypothetical protein  31.01 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.949648 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1687  hypothetical protein  34.58 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15521  hypothetical protein  30 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1840  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.89 
 
 
170 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2144  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.18 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4819  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.75 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5411  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.75 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398056  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5450  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.75 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488662 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0715  hypothetical protein  28.33 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.08 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15765  normal  0.357312 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04441  hypothetical protein  28.83 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.141762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07171  hypothetical protein  28.83 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1941  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.7 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0206301 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0675  hypothetical protein  31.15 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.916492  normal  0.175959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1814  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.89 
 
 
170 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2894  hypothetical protein  28.68 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000016603  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11891  hypothetical protein  28.83 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.811967  normal  0.0619225 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04851  hypothetical protein  28.35 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1838  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.77 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04751  hypothetical protein  32.14 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.154576  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.47 
 
 
141 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.411404  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0420  hypothetical protein  31.75 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.600155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2020  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.51 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10574  predicted protein  27.93 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0568  hypothetical protein  28.83 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3208  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.17 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346323  normal  0.0537298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2511  hypothetical protein  29.17 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768135  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0353  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.69 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1922  hypothetical protein  24.77 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0181  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.56 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385017  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0121  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.95 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0303  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.18 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1272  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.46 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1929  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.1 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0767  hypothetical protein  29.27 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5381  hypothetical protein  29.03 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.919604  normal  0.706787 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0236  hypothetical protein  26.77 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.368645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6771  hypothetical protein  29.63 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667149  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1605  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.72 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2743  hypothetical protein  32.43 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1617  hypothetical protein  22.22 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000141636  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32698  predicted protein  27.52 
 
 
770 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.782214  normal  0.0798771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>