42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0353 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0353  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  100 
 
 
122 aa  256  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1922  hypothetical protein  50.42 
 
 
125 aa  130  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6771  hypothetical protein  41.67 
 
 
124 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667149  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1929  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.91 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5381  hypothetical protein  34.58 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.919604  normal  0.706787 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1272  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.71 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.09 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15765  normal  0.357312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0767  hypothetical protein  34.78 
 
 
139 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3850  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.2 
 
 
293 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.386494 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3164  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.9 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2743  hypothetical protein  30.84 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0236  hypothetical protein  29.36 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.368645  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0904  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.04 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4062  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.69 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0170887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0121  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.91 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0568  hypothetical protein  29.36 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2624  hypothetical protein  30.65 
 
 
140 aa  50.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.718341  normal  0.010851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0201  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.97 
 
 
288 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0181  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.61 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385017  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0615  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.96 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.72548  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0610  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  22.81 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1482  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.78 
 
 
170 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.469356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3338  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.96 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3508  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.96 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281099  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3218  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  23.68 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00144282  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0771  hypothetical protein  25.22 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3626  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  22.81 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.95092  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3684  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  22.81 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.316801  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3808  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  22.81 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0344386  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03637  Potential redox protein  23.85 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223227  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1941  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.95 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0206301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3208  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.42 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346323  normal  0.0537298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2979  hypothetical protein  27.35 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00993093  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000970  cell division inhibitor  27.68 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2511  hypothetical protein  26.42 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768135  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2020  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.04 
 
 
137 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5450  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  24.53 
 
 
289 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488662 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4819  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  24.53 
 
 
289 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5411  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  24.53 
 
 
289 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398056  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2077  hypothetical protein  30.56 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.949648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1860  hypothetical protein  25.71 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147247  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0521  hypothetical protein  29.29 
 
 
125 aa  40.4  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.39093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>