35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1922 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1922  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  259  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0353  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  50.42 
 
 
122 aa  130  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6771  hypothetical protein  28.1 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667149  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1929  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.21 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5381  hypothetical protein  27.1 
 
 
133 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.919604  normal  0.706787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0767  hypothetical protein  25.24 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2624  hypothetical protein  31.45 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.718341  normal  0.010851 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0904  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  24.3 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4062  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  24.77 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0170887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0568  hypothetical protein  27.1 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1272  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  23.53 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2743  hypothetical protein  21.9 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590114  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  23.89 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.411404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3626  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  23.85 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.95092  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0610  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  23.85 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3218  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  24.77 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00144282  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3508  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  24.77 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281099  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1409  hypothetical protein  25.23 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3338  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  23.85 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3684  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  23.85 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.316801  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0615  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  23.85 
 
 
129 aa  47.8  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.72548  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3808  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  22.94 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0344386  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07021  hypothetical protein  23.68 
 
 
128 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0771  hypothetical protein  21.1 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1860  hypothetical protein  21.36 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0201  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  20.51 
 
 
288 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  20.51 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15765  normal  0.357312 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0181  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  21.1 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385017  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0236  hypothetical protein  23.15 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.368645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2144  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.36 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0121  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  21.3 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3850  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  20.18 
 
 
293 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.386494 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03637  Potential redox protein  20.75 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2979  hypothetical protein  22.22 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00993093  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3164  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.23 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>