120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2495 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_2495  putative methyltransferase  100 
 
 
236 aa  488  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2334  putative methyltransferase  74.8 
 
 
260 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50746  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1999  putative methyltransferase  57.14 
 
 
225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2885  putative methyltransferase  56.62 
 
 
226 aa  239  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00121582  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2933  putative methyltransferase  53.71 
 
 
264 aa  215  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0575  putative methyltransferase  45.16 
 
 
220 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.675433  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3929  putative methyltransferase  45.62 
 
 
225 aa  182  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1006  hypothetical protein  44.05 
 
 
251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0699  putative methyltransferase  43.38 
 
 
223 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.25876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03554  putative methyltransferase SAM dependent  39.72 
 
 
222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40360  predicted protein  36.84 
 
 
324 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5871  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.38 
 
 
288 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1981  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.57 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.613488  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1781  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.57 
 
 
260 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2473  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.87 
 
 
276 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3127  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.01 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5326  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.19 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1717  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.59 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  hitchhiker  0.000597874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4063  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.01 
 
 
247 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0405307  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2936  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25.84 
 
 
246 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1731  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  24.73 
 
 
273 aa  55.5  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0313572  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2905  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.55 
 
 
246 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542053  normal  0.839592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2013  hypothetical protein  25.28 
 
 
273 aa  55.1  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2167  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.65 
 
 
264 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0795  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28.11 
 
 
255 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0743  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.65 
 
 
264 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2576  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.65 
 
 
264 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2037  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.65 
 
 
264 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0806  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.72 
 
 
255 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0612  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.05 
 
 
257 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0758  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.88 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3119  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.65 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4022  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.27 
 
 
255 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1513  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.22 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0169064  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1896  hypothetical protein  26.63 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0439  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.32 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.361197  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0918  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.32 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533662  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3056  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.65 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83173  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3091  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28.65 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4166  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28.42 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1911  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25.29 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0984764 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0653  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.05 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.898323  normal  0.0665716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4739  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28.19 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.278865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0859  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25.71 
 
 
277 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0173  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  36.17 
 
 
275 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0182  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  36.17 
 
 
275 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0162  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  36.17 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408902  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3723  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  32.28 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.911528  normal  0.0171903 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0888  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.17 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.517085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3860  hypothetical protein  27.59 
 
 
246 aa  52.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00355604  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4050  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.34 
 
 
259 aa  52.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244378  normal  0.090551 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3592  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.56 
 
 
229 aa  52.4  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010395  normal  0.13719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0198  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  36.08 
 
 
266 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3118  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25.71 
 
 
260 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3919  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  31.21 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3033  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25.86 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0681444  normal  0.224483 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2850  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.06 
 
 
469 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.444447  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0703  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.68 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0435  methyltransferase, putative  27.66 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02990  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28.74 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0231  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25.13 
 
 
238 aa  50.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.840136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05000  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.7 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0481  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.7 
 
 
244 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1763  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  21.79 
 
 
266 aa  48.9  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0447954 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0606  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  24.31 
 
 
268 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5329  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.57 
 
 
241 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3145  hypothetical protein  25.82 
 
 
246 aa  48.5  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0366  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.33 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.133582  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2125  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  24.86 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1026  hypothetical protein  26.19 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0684  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  22.41 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37097  predicted protein  28.26 
 
 
237 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0716846  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1997  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  31.76 
 
 
220 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  hitchhiker  0.00554858 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00280  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25.27 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7016  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.1 
 
 
239 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.774499  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1532  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.84 
 
 
231 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.578287  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0069  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.09 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.662361  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2704  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  23.86 
 
 
262 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3362  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  21.43 
 
 
217 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0454  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  35 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  52.5 
 
 
223 aa  45.8  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2748  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  22.99 
 
 
220 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0761  methyltransferase, putative  29.17 
 
 
232 aa  45.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.88261e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1421  putative methyltransferase  26.04 
 
 
261 aa  45.4  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.622641  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18760  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  30.71 
 
 
331 aa  45.4  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.404471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0078  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  23.86 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.892836  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1543  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  23.18 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000423182  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0882  putative methyltransferase  26.58 
 
 
192 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5103  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.08 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0303  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  24.14 
 
 
306 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0377  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  24.44 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4976  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.08 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5153  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.08 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323183  normal  0.630661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39160  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25.15 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1403  putative methyltransferase  25 
 
 
221 aa  43.5  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.454064  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2026  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  30.43 
 
 
223 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3039  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.38 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0119  hypothetical protein  22.91 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0118328  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  34.83 
 
 
275 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3140  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  22.31 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>