41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1006 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1006  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  524  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0575  putative methyltransferase  48.02 
 
 		 220 aa  216  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.675433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3929  putative methyltransferase  47.79 
 
 		 225 aa  209  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03554  putative methyltransferase SAM dependent  44.49 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2495  putative methyltransferase  44.05 
 
 		 236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2933  putative methyltransferase  42.11 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2885  putative methyltransferase  41.92 
 
 		 226 aa  165  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1999  putative methyltransferase  40.61 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2334  putative methyltransferase  38.46 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50746  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0699  putative methyltransferase  37.99 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.25876  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40360  predicted protein  37.17 
 
 		 324 aa  105  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3168  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.59 
 
 		 312 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12115 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1403  putative methyltransferase  25 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.454064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1059  methyltransferase  25.45 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.946136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5326  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  23.46 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  35.82 
 
 		 440 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0882  putative methyltransferase  26.15 
 
 		 192 aa  46.2  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0102  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.5 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.229705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2026  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  23.98 
 
 		 223 aa  45.8  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0198  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.6 
 
 		 266 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1997  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.78 
 
 		 220 aa  45.4  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  hitchhiker  0.00554858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  36 
 
 		 247 aa  45.4  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0474  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  23.63 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  42.65 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4146  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  23.83 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61707  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  44.19 
 
 		 444 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 439 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3917  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.66 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0173  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0162  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408902  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0182  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1421  putative methyltransferase  36.19 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.622641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0149  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  24.04 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0586457  hitchhiker  0.00000543036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  28.81 
 
 		 314 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0820  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  24.04 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1569  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  30.3 
 
 		 213 aa  42.4  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0334963  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0821  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  23.5 
 
 		 239 aa  42  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.645043  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  30.25 
 
 		 275 aa  42.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  40.48 
 
 		 211 aa  42  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10210  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.84 
 
 		 263 aa  42  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.66059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0195  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28.42 
 
 		 255 aa  42  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>