90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0699 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0699  putative methyltransferase  100 
 
 
223 aa  464  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.25876  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2933  putative methyltransferase  54.17 
 
 
264 aa  223  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1999  putative methyltransferase  50.23 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0575  putative methyltransferase  44.91 
 
 
220 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.675433  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3929  putative methyltransferase  43.16 
 
 
225 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2885  putative methyltransferase  48.85 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00121582  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03554  putative methyltransferase SAM dependent  40.65 
 
 
222 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2495  putative methyltransferase  43.38 
 
 
236 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2334  putative methyltransferase  41.18 
 
 
260 aa  157  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50746  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1006  hypothetical protein  37.99 
 
 
251 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40360  predicted protein  36.45 
 
 
324 aa  108  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5871  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.78 
 
 
288 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1717  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.4 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  hitchhiker  0.000597874 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.41 
 
 
252 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4218  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.03 
 
 
216 aa  48.9  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.646333  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  41.94 
 
 
246 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0303  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  24.86 
 
 
306 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.8 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  31.3 
 
 
252 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.3 
 
 
252 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  41.94 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  29.57 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.3 
 
 
252 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.56 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.3 
 
 
252 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  45.61 
 
 
439 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1026  hypothetical protein  25.57 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.82 
 
 
258 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.82 
 
 
258 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.33 
 
 
256 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.25 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0176  hypothetical protein  36.26 
 
 
279 aa  46.6  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261727  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  37 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  44.19 
 
 
252 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.14 
 
 
252 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
243 aa  45.4  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.11 
 
 
257 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  41.51 
 
 
440 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  34.38 
 
 
213 aa  45.1  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.24 
 
 
271 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37510  hypothetical protein  33.04 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00412109  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0054  methyltransferase type 12  32.58 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  40.35 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1048  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.92 
 
 
455 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1997  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25.21 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  hitchhiker  0.00554858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.62 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  42.86 
 
 
441 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.62 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.62 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07721  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.95 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02990  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25.67 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  33.33 
 
 
307 aa  44.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.43 
 
 
252 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.74 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  42.86 
 
 
441 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  46 
 
 
444 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.85 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  40 
 
 
223 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0182  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.11 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00280  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  24.59 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1532  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.77 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.578287  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.64 
 
 
258 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0173  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.11 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0366  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28.36 
 
 
267 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.133582  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.18 
 
 
260 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0078  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  24.51 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.892836  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3025  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  23.86 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5326  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.66 
 
 
234 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39160  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25.77 
 
 
244 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.89 
 
 
285 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  41.67 
 
 
310 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.85 
 
 
268 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
199 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.53 
 
 
255 aa  42.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3919  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25 
 
 
248 aa  42.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  34.83 
 
 
311 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.29 
 
 
257 aa  42.4  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
256 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
247 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4063  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26 
 
 
247 aa  42.4  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0405307  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1421  putative methyltransferase  28.16 
 
 
261 aa  42.4  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.622641  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
256 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
256 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0198  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  23.67 
 
 
266 aa  42  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0162  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25.71 
 
 
267 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408902  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.42 
 
 
255 aa  41.6  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
240 aa  41.6  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.42 
 
 
255 aa  41.6  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0277  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28.81 
 
 
198 aa  41.6  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000164749  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>