123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0126 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0126  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 202 aa  396  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1176  orotate phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  32.67 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2703  orotate phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  29.44 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5893  phosphoribosyltransferase  29.85 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  28.89 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0239  orotate phosphoribosyltransferase  26.11 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1205  orotate phosphoribosyltransferase  33.75 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.118025  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3177  orotate phosphoribosyltransferase  25.14 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  37.7 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2669  orotate phosphoribosyltransferase  26.25 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0277  orotate phosphoribosyltransferase  24.04 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1938  orotate phosphoribosyltransferase  27.44 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4186  orotate phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1987  orotate phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0105796  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  24.85 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  21.99 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  23.68 
 
 		 479 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  23.68 
 
 		 479 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  26.75 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  24.05 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07951  orotate phosphoribosyltransferase  25.28 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0181  orotate phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 		 178 aa  51.2  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0771  orotate phosphoribosyltransferase  28 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0125  orotate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1046  orotate phosphoribosyltransferase  23.66 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0756339  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  27.48 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1264  orotate phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1289  orotate phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3008  orotate phosphoribosyltransferase  29.52 
 
 		 177 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0981  orotate phosphoribosyltransferase  24.06 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03081  orotate phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.691934  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1310  orotate phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1094  orotate phosphoribosyltransferase  34.43 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  37.78 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0130  orotate phosphoribosyltransferase  30.47 
 
 		 179 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000251206 
 
 
-
 
NC_002950  PG1353  orotate phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  34.86 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3103  orotate phosphoribosyltransferase  25.7 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  34.43 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2069  orotate phosphoribosyltransferase  29.71 
 
 		 182 aa  48.9  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  30.53 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2888  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0334106  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3646  orotate phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2123  orotate phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  24.18 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1342  adenine phosphoribosyltransferase  35.65 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0382674  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0263  orotate phosphoribosyltransferase  26.25 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2766  orotate phosphoribosyltransferase  26.89 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  27.13 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3708  orotate phosphoribosyltransferase  27.88 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  34.04 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  24.52 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02991  orotate phosphoribosyltransferase  24.18 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.734545  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  27.1 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8390  orotate phosphoribosyltransferase  30.87 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.353067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  29.01 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  35.14 
 
 		 477 aa  45.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0442  orotate phosphoribosyltransferase  20.55 
 
 		 184 aa  45.4  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.297345  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  25.81 
 
 		 482 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3568  orotate phosphoribosyltransferase  27.44 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0180203  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  24.1 
 
 		 183 aa  45.1  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  26.53 
 
 		 172 aa  44.7  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  23.81 
 
 		 500 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1721  orotate phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  22.5 
 
 		 451 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3634  orotate phosphoribosyltransferase  26.83 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.274017  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  37.1 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  37.1 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1086  xanthine phosphoribosyltransferase  22.7 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.821507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  30.12 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0881  adenine phosphoribosyltransferase  34.85 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0968  Adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>