More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7135 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5985  ubiquinol oxidase, subunit II  92.99 
 
 		 390 aa  724    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7135  ubiquinol oxidase, subunit II  100 
 
 		 371 aa  771    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.959293  normal  0.391928 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4372  ubiquinol oxidase, subunit II  77.98 
 
 		 392 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6217  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  69.39 
 
 		 370 aa  535  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4778  ubiquinol oxidase, subunit II  69.59 
 
 		 385 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213947  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4337  ubiquinol oxidase, subunit II  62.6 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4854  ubiquinol oxidase, subunit II  61.79 
 
 		 387 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4706  ubiquinol oxidase, subunit II  62.6 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4046  ubiquinol oxidase, subunit II  74.05 
 
 		 342 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25718  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5735  ubiquinol oxidase, subunit II  63.72 
 
 		 426 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010556 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4890  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  66 
 
 		 345 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0147207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1731  ubiquinol oxidase, subunit II  61.59 
 
 		 409 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0242  ubiquinol oxidase, subunit II  67.33 
 
 		 385 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0595  ubiquinol oxidase, subunit II  63.08 
 
 		 385 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1744  putative cytochrome o ubiquinol oxidase chain II protein  66.45 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2030  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  64.26 
 
 		 390 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5608  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  66.55 
 
 		 349 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1877  ubiquinol oxidase, subunit II  63.73 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1548  ubiquinol oxidase, subunit II  64.07 
 
 		 350 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.18234 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1508  ubiquinol oxidase, subunit II  56.15 
 
 		 409 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.205706  normal  0.237514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2223  ubiquinol oxidase, subunit II  64.29 
 
 		 349 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.0191751 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2775  ubiquinol oxidase, subunit II  62.5 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.608558 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2265  ubiquinol oxidase, subunit II  62.14 
 
 		 349 aa  388  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.384743  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4057  ubiquinol oxidase, subunit II  66.07 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.202899  normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5108  ubiquinol oxidase, subunit II  57.05 
 
 		 400 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2284  ubiquinol oxidase, subunit II  55.78 
 
 		 363 aa  349  4e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0048  ubiquinol oxidase, subunit II  53.93 
 
 		 335 aa  339  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0042  ubiquinol oxidase, subunit II  53.19 
 
 		 341 aa  334  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0042  ubiquinol oxidase, subunit II  52.84 
 
 		 341 aa  331  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2714  ubiquinol oxidase, subunit II  55.25 
 
 		 296 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.218735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1788  ubiquinol oxidase, subunit II  54.86 
 
 		 377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0548313  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0993  ubiquinol oxidase, subunit II  55.25 
 
 		 300 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0479  ubiquinol oxidase, subunit II  54.86 
 
 		 295 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0603  ubiquinol oxidase, subunit II  55.25 
 
 		 296 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0194  ubiquinol oxidase, subunit II  55.25 
 
 		 300 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2833  ubiquinol oxidase polypeptide II precursor  55.25 
 
 		 296 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2772  ubiquinol oxidase, subunit II  55.25 
 
 		 296 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1369  ubiquinol oxidase, subunit II  55.25 
 
 		 300 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1722  ubiquinol oxidase, subunit II  55.25 
 
 		 282 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243968  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2880  ubiquinol oxidase, subunit II  55.25 
 
 		 282 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0225  ubiquinol oxidase, subunit II  55.25 
 
 		 295 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2410  ubiquinol oxidase, subunit II  55.25 
 
 		 282 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1566  ubiquinol oxidase, subunit II  55.25 
 
 		 295 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2716  ubiquinol oxidase, subunit II  55.25 
 
 		 330 aa  305  7e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2572  ubiquinol oxidase, subunit II  55.25 
 
 		 330 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3163  ubiquinol oxidase, subunit II  50.7 
 
 		 320 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2814  ubiquinol oxidase, subunit II  50.7 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3968  ubiquinol oxidase, subunit II  53.31 
 
 		 300 aa  295  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47210  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  52.31 
 
 		 331 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000853268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0812  ubiquinol oxidase subunit 2  53.67 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.642349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1325  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  48.31 
 
 		 313 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1141  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  46.02 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.408263 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5376  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  52.92 
 
 		 283 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0835  ubiquinol oxidase, subunit II  53.67 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3649  ubiquinol oxidase, subunit II  50.97 
 
 		 299 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1209  ubiquinol oxidase, subunit II  52.53 
 
 		 295 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0864701  normal  0.353676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4376  ubiquinol oxidase, subunit II  50.69 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.918748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0849  ubiquinol oxidase, subunit II  53.67 
 
 		 313 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0948  ubiquinol oxidase, subunit II  52.33 
 
 		 322 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4579  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  50.39 
 
 		 306 aa  292  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5009  ubiquinol oxidase, subunit II  52.53 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348819  normal  0.0229485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4073  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  51.54 
 
 		 326 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581224  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2090  ubiquinol oxidase, subunit II  52.53 
 
 		 281 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6006  ubiquinol oxidase, subunit II  52.53 
 
 		 295 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2071  ubiquinol oxidase, subunit II  52.53 
 
 		 295 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.741779  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5793  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  48.51 
 
 		 319 aa  288  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0258171  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1043  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  52.49 
 
 		 320 aa  286  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0760278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3269  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  52.11 
 
 		 320 aa  286  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854016  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1295  ubiquinol oxidase, subunit II  48.65 
 
 		 295 aa  285  7e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000833627  hitchhiker  0.00150484 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1637  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  51.36 
 
 		 297 aa  285  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140878  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00009  ubiquinol oxidase, subunit II  51.34 
 
 		 311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.829439  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0366  ubiquinol oxidase, subunit II  49.22 
 
 		 316 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3073  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  47.96 
 
 		 317 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0741  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  49.62 
 
 		 319 aa  276  4e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.586473  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2917  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  51.92 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.215988  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0656  ubiquinol oxidase, subunit II  49.62 
 
 		 319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1290  ubiquinol oxidase, subunit II  48.06 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2882  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  51.15 
 
 		 317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2107  ubiquinol oxidase, subunit II  52.92 
 
 		 295 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295579  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1977  ubiquinol oxidase, subunit II  52.92 
 
 		 283 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3098  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  50.19 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3060  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  50.19 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000967712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3241  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  50.19 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.46443  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0224  ubiquinol oxidase, subunit II  50 
 
 		 346 aa  269  7e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4218  ubiquinol oxidase, subunit II  51.55 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4146  ubiquinol oxidase, subunit II  50.78 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1858  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  45.52 
 
 		 330 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.2499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4648  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  48.91 
 
 		 313 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.117472  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0954  ubiquinol oxidase, subunit II  47.27 
 
 		 302 aa  266  5e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3858  ubiquinol oxidase, subunit II  50.78 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4350  ubiquinol oxidase, subunit II  47.6 
 
 		 351 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3823  ubiquinol oxidase, subunit II  49.81 
 
 		 342 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3914  ubiquinol oxidase, subunit II  49.81 
 
 		 342 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0982  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  51.92 
 
 		 323 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0433  ubiquinol oxidase, subunit II  51.35 
 
 		 306 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.984358  normal  0.776593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0354  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  44.41 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0519619  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5824  ubiquinol oxidase, subunit II  47.49 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0472  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  44.41 
 
 		 315 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0507  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  44.41 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.47547e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0467  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  44.41 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>