More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4337 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4706  ubiquinol oxidase, subunit II  100 
 
 
387 aa  804    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4337  ubiquinol oxidase, subunit II  100 
 
 
387 aa  804    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195631  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4854  ubiquinol oxidase, subunit II  93.54 
 
 
387 aa  741    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4778  ubiquinol oxidase, subunit II  75.93 
 
 
385 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213947  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5985  ubiquinol oxidase, subunit II  67.06 
 
 
390 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4372  ubiquinol oxidase, subunit II  63.14 
 
 
392 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1731  ubiquinol oxidase, subunit II  64.66 
 
 
409 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5735  ubiquinol oxidase, subunit II  64.08 
 
 
426 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010556 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7135  ubiquinol oxidase, subunit II  62.6 
 
 
371 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.959293  normal  0.391928 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6217  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  59.26 
 
 
370 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4890  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  61.02 
 
 
345 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0147207  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4046  ubiquinol oxidase, subunit II  68.06 
 
 
342 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25718  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5608  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  62.99 
 
 
349 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0242  ubiquinol oxidase, subunit II  61.89 
 
 
385 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0595  ubiquinol oxidase, subunit II  60.78 
 
 
385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2265  ubiquinol oxidase, subunit II  64.91 
 
 
349 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.384743  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2775  ubiquinol oxidase, subunit II  64.91 
 
 
349 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.608558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2030  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  63.21 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463087  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2223  ubiquinol oxidase, subunit II  64.91 
 
 
349 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.0191751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1877  ubiquinol oxidase, subunit II  62.08 
 
 
350 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1548  ubiquinol oxidase, subunit II  61.74 
 
 
350 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.18234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4057  ubiquinol oxidase, subunit II  67.25 
 
 
348 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.202899  normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1744  putative cytochrome o ubiquinol oxidase chain II protein  58.59 
 
 
343 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195887  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1508  ubiquinol oxidase, subunit II  59.6 
 
 
409 aa  385  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.205706  normal  0.237514 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5108  ubiquinol oxidase, subunit II  56.57 
 
 
400 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2284  ubiquinol oxidase, subunit II  55.41 
 
 
363 aa  359  5e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3163  ubiquinol oxidase, subunit II  53.7 
 
 
320 aa  319  7e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193741 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00009  ubiquinol oxidase, subunit II  52.13 
 
 
311 aa  315  8e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.829439  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2814  ubiquinol oxidase, subunit II  53.05 
 
 
340 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0048  ubiquinol oxidase, subunit II  47.64 
 
 
335 aa  312  6.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0042  ubiquinol oxidase, subunit II  46.98 
 
 
341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0042  ubiquinol oxidase, subunit II  46.64 
 
 
341 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4579  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  52.08 
 
 
306 aa  299  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47210  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  48.01 
 
 
331 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000853268  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0479  ubiquinol oxidase, subunit II  50.94 
 
 
295 aa  292  8e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1209  ubiquinol oxidase, subunit II  48.62 
 
 
295 aa  292  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0864701  normal  0.353676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0948  ubiquinol oxidase, subunit II  49.62 
 
 
322 aa  292  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4073  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  47.37 
 
 
326 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581224  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0194  ubiquinol oxidase, subunit II  50.57 
 
 
300 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1369  ubiquinol oxidase, subunit II  50.57 
 
 
300 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0993  ubiquinol oxidase, subunit II  50.57 
 
 
300 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0225  ubiquinol oxidase, subunit II  50.57 
 
 
295 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1566  ubiquinol oxidase, subunit II  50.57 
 
 
295 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2716  ubiquinol oxidase, subunit II  50.57 
 
 
330 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3269  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  48.57 
 
 
320 aa  290  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854016  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1788  ubiquinol oxidase, subunit II  49.15 
 
 
377 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0548313  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2572  ubiquinol oxidase, subunit II  50.57 
 
 
330 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2772  ubiquinol oxidase, subunit II  49.31 
 
 
296 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0603  ubiquinol oxidase, subunit II  49.31 
 
 
296 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2833  ubiquinol oxidase polypeptide II precursor  49.31 
 
 
296 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2714  ubiquinol oxidase, subunit II  49.31 
 
 
296 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.218735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1043  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  48.93 
 
 
320 aa  290  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0760278  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0812  ubiquinol oxidase subunit 2  48.41 
 
 
313 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.642349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0835  ubiquinol oxidase, subunit II  48.41 
 
 
313 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0741  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  49.62 
 
 
319 aa  289  6e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.586473  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4376  ubiquinol oxidase, subunit II  48.41 
 
 
314 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.918748  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0849  ubiquinol oxidase, subunit II  48.41 
 
 
313 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0656  ubiquinol oxidase, subunit II  49.62 
 
 
319 aa  288  9e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5793  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  48.91 
 
 
319 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0258171  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2880  ubiquinol oxidase, subunit II  50.38 
 
 
282 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1722  ubiquinol oxidase, subunit II  50.38 
 
 
282 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2410  ubiquinol oxidase, subunit II  50.38 
 
 
282 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5824  ubiquinol oxidase, subunit II  50.56 
 
 
305 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3649  ubiquinol oxidase, subunit II  47.02 
 
 
299 aa  285  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5009  ubiquinol oxidase, subunit II  47.42 
 
 
299 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348819  normal  0.0229485 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3968  ubiquinol oxidase, subunit II  48.23 
 
 
300 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44494  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3073  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  44.84 
 
 
317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3177  ubiquinol oxidase, subunit II  47.57 
 
 
315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302564  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0472  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  47.57 
 
 
315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304701  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0354  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  47.57 
 
 
315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0519619  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0516  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  47.57 
 
 
315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000162933  normal  0.952162 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6006  ubiquinol oxidase, subunit II  47.59 
 
 
295 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2071  ubiquinol oxidase, subunit II  47.59 
 
 
295 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.741779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00383  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  47.57 
 
 
315 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000068734  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3201  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  47.57 
 
 
315 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  hitchhiker  0.0000824271 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2090  ubiquinol oxidase, subunit II  49.81 
 
 
281 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158358  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1141  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  42.41 
 
 
313 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.408263 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00387  hypothetical protein  47.57 
 
 
315 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000137293  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0467  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  47.57 
 
 
315 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0507  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  47.57 
 
 
315 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.47547e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0490  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  46.49 
 
 
318 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000373186  hitchhiker  0.00204632 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2882  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  48.75 
 
 
317 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0484  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  46.49 
 
 
318 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000643315  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5376  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  49.43 
 
 
283 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0501  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  46.49 
 
 
318 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000104856  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2917  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  51.48 
 
 
329 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.215988  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0545  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  47.35 
 
 
309 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00734942  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0482  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  47.35 
 
 
309 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1325  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  42.11 
 
 
313 aa  279  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1858  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  47.43 
 
 
330 aa  275  8e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.2499 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1295  ubiquinol oxidase, subunit II  44.09 
 
 
295 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000833627  hitchhiker  0.00150484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1140  ubiquinol oxidase, subunit II  46.29 
 
 
351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0899  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  45.14 
 
 
315 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000156741  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0366  ubiquinol oxidase, subunit II  43.43 
 
 
316 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3098  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  45.77 
 
 
318 aa  272  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3241  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  45.77 
 
 
318 aa  272  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.46443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3060  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  45.77 
 
 
318 aa  272  6e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000967712  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1637  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  47.73 
 
 
297 aa  272  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140878  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0954  ubiquinol oxidase, subunit II  44.33 
 
 
302 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3795  ubiquinol oxidase, subunit II  45.88 
 
 
301 aa  267  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>