More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0366 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0366  ubiquinol oxidase, subunit II  100 
 
 
316 aa  658    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3823  ubiquinol oxidase, subunit II  73.89 
 
 
342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3914  ubiquinol oxidase, subunit II  73.89 
 
 
342 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3858  ubiquinol oxidase, subunit II  72.87 
 
 
347 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4218  ubiquinol oxidase, subunit II  76.98 
 
 
361 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4146  ubiquinol oxidase, subunit II  74.34 
 
 
367 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0224  ubiquinol oxidase, subunit II  79.5 
 
 
346 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0433  ubiquinol oxidase, subunit II  75.26 
 
 
306 aa  431  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.984358  normal  0.776593 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4031  ubiquinol oxidase, subunit II  69.67 
 
 
342 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4350  ubiquinol oxidase, subunit II  73 
 
 
351 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1290  ubiquinol oxidase, subunit II  66.12 
 
 
308 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03912  Ubiquinol oxidase polypeptide II (Cytochrome o subunit 2) (Oxidase BO(3) subunit 2) (Cytochrome o ubiquinol oxidase subunit  72.86 
 
 
313 aa  408  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0089  ubiquinol oxidase, subunit II  60.56 
 
 
348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4073  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  63.77 
 
 
326 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47210  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  63.77 
 
 
331 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000853268  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1295  ubiquinol oxidase, subunit II  57.82 
 
 
295 aa  345  8e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000833627  hitchhiker  0.00150484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0812  ubiquinol oxidase subunit 2  56.77 
 
 
313 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.642349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0835  ubiquinol oxidase, subunit II  56.77 
 
 
313 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0849  ubiquinol oxidase, subunit II  56.44 
 
 
313 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3163  ubiquinol oxidase, subunit II  59.85 
 
 
320 aa  338  7e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193741 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3073  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  54.72 
 
 
317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3241  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  55.81 
 
 
318 aa  335  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.46443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3060  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  55.81 
 
 
318 aa  335  5e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000967712  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3649  ubiquinol oxidase, subunit II  57.79 
 
 
299 aa  335  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3098  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  55.81 
 
 
318 aa  335  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1043  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  53.82 
 
 
320 aa  335  7e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0760278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3269  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  54.14 
 
 
320 aa  335  7.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854016  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0479  ubiquinol oxidase, subunit II  56.98 
 
 
295 aa  334  9e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00009  ubiquinol oxidase, subunit II  55.4 
 
 
311 aa  334  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.829439  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4376  ubiquinol oxidase, subunit II  55.92 
 
 
314 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.918748  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1788  ubiquinol oxidase, subunit II  54.2 
 
 
377 aa  334  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0548313  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1369  ubiquinol oxidase, subunit II  58.3 
 
 
300 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0194  ubiquinol oxidase, subunit II  58.3 
 
 
300 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2772  ubiquinol oxidase, subunit II  56.46 
 
 
296 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2833  ubiquinol oxidase polypeptide II precursor  56.46 
 
 
296 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0993  ubiquinol oxidase, subunit II  58.3 
 
 
300 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2716  ubiquinol oxidase, subunit II  58.3 
 
 
330 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0225  ubiquinol oxidase, subunit II  58.3 
 
 
295 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1566  ubiquinol oxidase, subunit II  58.3 
 
 
295 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2572  ubiquinol oxidase, subunit II  58.3 
 
 
330 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0354  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  53.9 
 
 
315 aa  332  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0519619  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00383  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  53.9 
 
 
315 aa  332  6e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000068734  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3201  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  53.9 
 
 
315 aa  332  6e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  hitchhiker  0.0000824271 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00387  hypothetical protein  53.9 
 
 
315 aa  332  6e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000137293  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0507  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  53.9 
 
 
315 aa  331  8e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.47547e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2814  ubiquinol oxidase, subunit II  59.62 
 
 
340 aa  331  8e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0467  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  53.9 
 
 
315 aa  331  8e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0603  ubiquinol oxidase, subunit II  58.46 
 
 
296 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2714  ubiquinol oxidase, subunit II  55.36 
 
 
296 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.218735  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3177  ubiquinol oxidase, subunit II  53.9 
 
 
315 aa  330  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302564  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0501  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  49.54 
 
 
318 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000104856  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0472  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  53.9 
 
 
315 aa  330  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304701  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0516  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  53.55 
 
 
315 aa  330  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000162933  normal  0.952162 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0484  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  49.54 
 
 
318 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000643315  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1325  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  54.51 
 
 
313 aa  329  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1722  ubiquinol oxidase, subunit II  58.46 
 
 
282 aa  329  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243968  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2880  ubiquinol oxidase, subunit II  58.46 
 
 
282 aa  329  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2410  ubiquinol oxidase, subunit II  58.46 
 
 
282 aa  329  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0490  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  49.54 
 
 
318 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000373186  hitchhiker  0.00204632 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4579  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  52.56 
 
 
306 aa  328  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1209  ubiquinol oxidase, subunit II  54.58 
 
 
295 aa  328  6e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0864701  normal  0.353676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0545  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  51.49 
 
 
309 aa  328  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00734942  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2882  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  53.42 
 
 
317 aa  328  8e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0482  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  51.49 
 
 
309 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1141  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  58.02 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.408263 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0656  ubiquinol oxidase, subunit II  57.47 
 
 
319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0948  ubiquinol oxidase, subunit II  58.87 
 
 
322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6006  ubiquinol oxidase, subunit II  55.84 
 
 
295 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2071  ubiquinol oxidase, subunit II  55.84 
 
 
295 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.741779  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2090  ubiquinol oxidase, subunit II  55.84 
 
 
281 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158358  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0741  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  57.47 
 
 
319 aa  325  7e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.586473  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0899  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  52.48 
 
 
315 aa  324  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000156741  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5376  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  55.47 
 
 
283 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5793  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  53.79 
 
 
319 aa  322  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0258171  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5009  ubiquinol oxidase, subunit II  54.51 
 
 
299 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348819  normal  0.0229485 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2917  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  58.12 
 
 
329 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.215988  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0954  ubiquinol oxidase, subunit II  54.34 
 
 
302 aa  310  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3968  ubiquinol oxidase, subunit II  53.99 
 
 
300 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44494  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1858  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  52.53 
 
 
330 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.2499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1090  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  51.58 
 
 
316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000286734  hitchhiker  0.00000462839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0982  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  60 
 
 
323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0042  ubiquinol oxidase, subunit II  53.45 
 
 
341 aa  306  3e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0042  ubiquinol oxidase, subunit II  53.45 
 
 
341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0163  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II (ubiquinol oxidase subunit 2 precursor)  58.71 
 
 
307 aa  305  6e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5824  ubiquinol oxidase, subunit II  51.28 
 
 
305 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0048  ubiquinol oxidase, subunit II  52.94 
 
 
335 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184158  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3795  ubiquinol oxidase, subunit II  51.3 
 
 
301 aa  302  4.0000000000000003e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1140  ubiquinol oxidase, subunit II  50.35 
 
 
351 aa  302  5.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1637  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  54.26 
 
 
297 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140878  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4648  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  55.4 
 
 
313 aa  301  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.117472  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1977  ubiquinol oxidase, subunit II  55.11 
 
 
283 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2107  ubiquinol oxidase, subunit II  55.11 
 
 
295 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295579  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4890  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  47.12 
 
 
345 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0147207  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0259  ubiquinol oxidase, subunit II  52.8 
 
 
307 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.144831  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05491  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  55.56 
 
 
273 aa  292  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4372  ubiquinol oxidase, subunit II  48.69 
 
 
392 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5985  ubiquinol oxidase, subunit II  48.74 
 
 
390 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1877  ubiquinol oxidase, subunit II  46.07 
 
 
350 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4046  ubiquinol oxidase, subunit II  47.35 
 
 
342 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25718  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1548  ubiquinol oxidase, subunit II  45.71 
 
 
350 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.18234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>