More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2593 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2593  putative carboxylesterase protein  100 
 
 		 475 aa  960    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11690  carboxylesterase type B  42.55 
 
 		 487 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0371403  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5478  carboxylesterase, type B  35.6 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0571044  decreased coverage  0.00892297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0812  Carboxylesterase  32.82 
 
 		 540 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0610  Carboxylesterase type B  31.94 
 
 		 506 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0415  Carboxylesterase type B  36.84 
 
 		 519 aa  143  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3983  carboxylesterase, type B  32.39 
 
 		 503 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3037  carboxylesterase, type B  39.55 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.505408  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4145  Carboxylesterase  31.75 
 
 		 542 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3236  carboxylesterase type B  32.56 
 
 		 497 aa  137  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0976  Carboxylesterase  29.91 
 
 		 518 aa  137  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0892066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0684  Carboxylesterase  32.11 
 
 		 506 aa  136  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00959142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4879  Carboxylesterase  34.5 
 
 		 456 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0135743 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3129  Carboxylesterase  33.97 
 
 		 498 aa  133  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4416  Carboxylesterase type B  30.7 
 
 		 507 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5611  Carboxylesterase  34.62 
 
 		 503 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02490  carboxylesterase type B  29.05 
 
 		 501 aa  131  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0723  Carboxylesterase  31.41 
 
 		 508 aa  131  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0653  Carboxylesterase  29.35 
 
 		 543 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1148  carboxylesterase, type B  31.9 
 
 		 507 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3419  carboxylesterase, type B  33.33 
 
 		 517 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0251652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3787  carboxylesterase, type B  36.6 
 
 		 503 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4535  Carboxylesterase  31.33 
 
 		 492 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2609  carboxylesterase, type B  40.91 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0169625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1801  carboxylesterase, type B  40.17 
 
 		 502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.712791 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1619  carboxylesterase, type B  31.11 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1534  carboxylesterase, type B  40.17 
 
 		 502 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1719  carboxylesterase, type B  40.17 
 
 		 502 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.11342 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3226  carboxylesterase  40.51 
 
 		 525 aa  128  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114767  normal  0.0637865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1737  carboxylesterase, type B  40.17 
 
 		 502 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6769  Carboxylesterase type B  37.04 
 
 		 541 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.681683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4223  carboxylesterase, type B  34.39 
 
 		 553 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12082  carboxylesterase lipT  33.99 
 
 		 511 aa  127  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2511  carboxylesterase, type B  41.24 
 
 		 528 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2556  carboxylesterase, type B  40.82 
 
 		 502 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2548  carboxylesterase, type B  40.82 
 
 		 502 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2427  putative carboxylesterase  34.17 
 
 		 497 aa  126  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1141  carboxylesterase type B  28.64 
 
 		 551 aa  126  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1741  carboxylesterase, type B  39.57 
 
 		 502 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4595  carboxylesterase, type B  38.79 
 
 		 502 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6351  Carboxylesterase type B  30.73 
 
 		 506 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.567991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2344  carboxylesterase, type B  39.25 
 
 		 498 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.865646  normal  0.0140105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4016  Carboxylesterase type B  35.42 
 
 		 551 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137205  hitchhiker  0.000523092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2352  carboxylesterase, type B  39.25 
 
 		 498 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.158305 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02879  hypothetical protein  34.46 
 
 		 549 aa  123  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1529  Carboxylesterase  34.93 
 
 		 533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348412  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0353  Carboxylesterase type B  33.91 
 
 		 578 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5081  Carboxylesterase  37.88 
 
 		 546 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560084  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1428  Carboxylesterase type B  29.67 
 
 		 513 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2865  carboxylesterase, type B  32.22 
 
 		 523 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2895  carboxylesterase, type B  32.22 
 
 		 523 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.794639 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2909  carboxylesterase, type B  32.22 
 
 		 523 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1904  Carboxylesterase type B  27.29 
 
 		 529 aa  120  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0256  Carboxylesterase  31.85 
 
 		 547 aa  119  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0321  Carboxylesterase  31.22 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1303  carboxylesterase, type B  33.62 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147042 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4141  Carboxylesterase  30.54 
 
 		 496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1944  Carboxylesterase  36.33 
 
 		 553 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  0.353299 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0459  Carboxylesterase  36.12 
 
 		 490 aa  118  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2305  carboxylesterase, type B  42.23 
 
 		 443 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.240607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3172  carboxylesterase, type B  33.92 
 
 		 523 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.752046  normal  0.0347741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1892  Carboxylesterase  32.6 
 
 		 500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3026  Carboxylesterase type B  36.19 
 
 		 509 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4869  carboxylesterase type B  45.14 
 
 		 555 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0762  Carboxylesterase  31.6 
 
 		 524 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3408  carboxylesterase, type B  47.06 
 
 		 502 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464351  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4013  carboxylesterase type B  38.35 
 
 		 547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0954265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1038  carboxylesterase, type B  38.84 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1584  carboxylesterase, type B  34.21 
 
 		 522 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1011  carboxylesterase, type B  34.1 
 
 		 516 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6663  Carboxylesterase type B  32.71 
 
 		 569 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.453104 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4266  carboxylesterase, type B  32.45 
 
 		 528 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.42892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1028  carboxylesterase, type B  34.1 
 
 		 535 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5051  carboxylesterase, type B  42.42 
 
 		 507 aa  114  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1506  Carboxylesterase  31.12 
 
 		 529 aa  113  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3125  carboxylesterase, type B  41.18 
 
 		 520 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.616834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0954  carboxylesterase, type B  29.78 
 
 		 523 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3517  carboxylesterase, type B  37.31 
 
 		 514 aa  113  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0670  Acetylcholinesterase  34.52 
 
 		 518 aa  113  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5622  Carboxylesterase  38.14 
 
 		 521 aa  113  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00384767 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3569  carboxylesterase, type B  38.67 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0182  carboxylesterase, type B  45.32 
 
 		 565 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2074  carboxylesterase, type B  38.94 
 
 		 537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.169494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0247  Acetylcholinesterase  31.1 
 
 		 517 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2898  Carboxylesterase type B  29.65 
 
 		 553 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223116  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1863  carboxylesterase, type B  39.72 
 
 		 569 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1039  carboxylesterase type B  37.57 
 
 		 534 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3813  Carboxylesterase type B  44.03 
 
 		 459 aa  110  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1873  Carboxylesterase type B  40 
 
 		 532 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622248 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02970  conserved hypothetical protein  40.65 
 
 		 640 aa  110  8.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.074434  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0067  carboxylesterase, type B  39.39 
 
 		 646 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0305  Carboxylesterase type B  41.36 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1730  carboxylesterase, type B  44.59 
 
 		 497 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338702  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0510  carboxylesterase  34.1 
 
 		 554 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611119  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0226  carboxylesterase, type B  40.85 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2915  Carboxylesterase  38.76 
 
 		 501 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2035  carboxylesterase family protein  30.99 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0603486  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0145  carboxylesterase, type B  39.79 
 
 		 445 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4599  carboxylesterase type B  39.8 
 
 		 553 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2745  Carboxylesterase type B  29.37 
 
 		 496 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>