23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4203 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4203  nitrogen fixation-related protein  100 
 
 		 146 aa  299  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4305  nitrogen fixation-related protein  85.61 
 
 		 132 aa  233  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.605655  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1209  hypothetical protein  81.54 
 
 		 130 aa  217  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3225  nitrogen fixation-related protein  69.47 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1925  hypothetical protein  60.8 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1840  hypothetical protein  63.93 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141385  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0199  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  49.09 
 
 		 118 aa  110  9e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0395191  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2036  hypothetical protein  50.45 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1474  hypothetical protein  45.45 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2385  hypothetical protein  67.65 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127314  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2038  hypothetical protein  43.22 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.410974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4545  hypothetical protein  43.64 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50900  nitrogen fixation-related protein  40.68 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464891  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2455  hypothetical protein  40 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.91939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3498  hypothetical protein  40.91 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.828835  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1872  hypothetical protein  40 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.796708 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1941  nitrogen fixation-related protein  42.11 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000861237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1984  nitrogen fixation-related protein  39.81 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2133  hypothetical protein  37.3 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3461  nitrogen fixation-related protein  35.4 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2642  nitrogen fixation-related protein  34.13 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0534  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.17 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0628  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25 
 
 		 419 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0599345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>