21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2642 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2642  nitrogen fixation-related protein  100 
 
 
121 aa  247  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3461  nitrogen fixation-related protein  98.35 
 
 
121 aa  243  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2133  hypothetical protein  70.25 
 
 
121 aa  187  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3225  nitrogen fixation-related protein  35.48 
 
 
133 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1209  hypothetical protein  34.4 
 
 
130 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4305  nitrogen fixation-related protein  32.54 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.605655  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4203  nitrogen fixation-related protein  34.13 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2036  hypothetical protein  33.62 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147372  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1840  hypothetical protein  34.15 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141385  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0199  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.46 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0395191  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1474  hypothetical protein  31.19 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1925  hypothetical protein  31.19 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2455  hypothetical protein  33.94 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.91939  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3498  hypothetical protein  32.17 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.828835  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1984  nitrogen fixation-related protein  31.3 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1872  hypothetical protein  31.19 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.796708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4545  hypothetical protein  34.86 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1941  nitrogen fixation-related protein  38.61 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000861237  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2038  hypothetical protein  28.04 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.410974  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2385  hypothetical protein  33.9 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127314  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50900  nitrogen fixation-related protein  24.32 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>