34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0199 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0199  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  100 
 
 
118 aa  243  8e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0395191  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3225  nitrogen fixation-related protein  50.86 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1209  hypothetical protein  50 
 
 
130 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4203  nitrogen fixation-related protein  49.09 
 
 
146 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4305  nitrogen fixation-related protein  49.09 
 
 
132 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.605655  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1840  hypothetical protein  54.84 
 
 
121 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141385  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1925  hypothetical protein  47.75 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1984  nitrogen fixation-related protein  44.66 
 
 
119 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2036  hypothetical protein  44.34 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1474  hypothetical protein  36.79 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2133  hypothetical protein  37.17 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50900  nitrogen fixation-related protein  37.5 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464891  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1941  nitrogen fixation-related protein  38.24 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000861237  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3461  nitrogen fixation-related protein  32.46 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2642  nitrogen fixation-related protein  32.46 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2455  hypothetical protein  34.55 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.91939  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2385  hypothetical protein  50.85 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127314  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3498  hypothetical protein  28.3 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.828835  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2038  hypothetical protein  30.77 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.410974  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1872  hypothetical protein  31.13 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.796708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4545  hypothetical protein  29.25 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0534  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.33 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0631  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.7 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2803  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  32.61 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1986  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.45 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0673  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.66 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.651625 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1397  nitrogenase iron-molybdenum cofactor maturation domain protein family  30.71 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0681076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1204  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.87 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1443  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.05 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.103803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18360  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.89 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000074108  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1532  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  25.58 
 
 
130 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000412529  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0994  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  28.74 
 
 
503 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2420  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.27 
 
 
109 aa  41.2  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0465  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.86 
 
 
116 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>