21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2455 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2455  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  265  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.91939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3498  hypothetical protein  85.38 
 
 		 130 aa  233  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.828835  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4545  hypothetical protein  79.23 
 
 		 142 aa  219  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1872  hypothetical protein  70.77 
 
 		 130 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.796708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1474  hypothetical protein  68.46 
 
 		 130 aa  191  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2038  hypothetical protein  65.15 
 
 		 143 aa  177  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.410974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2036  hypothetical protein  42.75 
 
 		 128 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147372  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4203  nitrogen fixation-related protein  40 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1209  hypothetical protein  42.73 
 
 		 130 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1840  hypothetical protein  43.64 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141385  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3225  nitrogen fixation-related protein  44.34 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4305  nitrogen fixation-related protein  40.91 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.605655  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1984  nitrogen fixation-related protein  40.19 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1925  hypothetical protein  39.82 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1941  nitrogen fixation-related protein  30.83 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000861237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3461  nitrogen fixation-related protein  33.94 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0199  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.55 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0395191  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2642  nitrogen fixation-related protein  33.94 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50900  nitrogen fixation-related protein  34.82 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464891  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2133  hypothetical protein  34.19 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2385  hypothetical protein  42.25 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127314  normal  0.230216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>