23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_50900 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_50900  nitrogen fixation-related protein  100 
 
 		 131 aa  261  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464891  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4203  nitrogen fixation-related protein  40.68 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4305  nitrogen fixation-related protein  41.88 
 
 		 132 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.605655  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2036  hypothetical protein  48.25 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147372  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1209  hypothetical protein  39.13 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3225  nitrogen fixation-related protein  39.02 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1925  hypothetical protein  40.91 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1474  hypothetical protein  41.44 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1872  hypothetical protein  40.54 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.796708 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2038  hypothetical protein  39.45 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.410974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4545  hypothetical protein  37.82 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0199  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  37.5 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0395191  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1840  hypothetical protein  36.52 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141385  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2455  hypothetical protein  34.82 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.91939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3498  hypothetical protein  34.78 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.828835  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2133  hypothetical protein  32.23 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1941  nitrogen fixation-related protein  31.86 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000861237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3461  nitrogen fixation-related protein  25.23 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2429  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  26.81 
 
 		 119 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1984  nitrogen fixation-related protein  35.8 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2385  hypothetical protein  35.29 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127314  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2642  nitrogen fixation-related protein  24.32 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4924  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  31.52 
 
 		 490 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>