22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1840 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1840  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  238  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141385  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3225  nitrogen fixation-related protein  68.33 
 
 		 133 aa  159  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4305  nitrogen fixation-related protein  65.08 
 
 		 132 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.605655  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1209  hypothetical protein  65.57 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4203  nitrogen fixation-related protein  63.93 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1925  hypothetical protein  66.36 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0199  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  51.82 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0395191  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2455  hypothetical protein  43.64 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.91939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3498  hypothetical protein  41.82 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.828835  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2036  hypothetical protein  47.83 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147372  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1984  nitrogen fixation-related protein  45.63 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1474  hypothetical protein  41.82 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4545  hypothetical protein  41.82 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1872  hypothetical protein  43.64 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.796708 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2038  hypothetical protein  40.74 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.410974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2385  hypothetical protein  64.38 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127314  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3461  nitrogen fixation-related protein  32.79 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1941  nitrogen fixation-related protein  43.62 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000861237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2642  nitrogen fixation-related protein  34.15 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2133  hypothetical protein  34.96 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50900  nitrogen fixation-related protein  36.52 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464891  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0534  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.87 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>