21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1872 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1872  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  260  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.796708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4545  hypothetical protein  69.23 
 
 
142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3498  hypothetical protein  70.77 
 
 
130 aa  196  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.828835  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2455  hypothetical protein  70.77 
 
 
130 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.91939  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1474  hypothetical protein  67.69 
 
 
130 aa  189  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2038  hypothetical protein  61.83 
 
 
143 aa  169  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.410974  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2036  hypothetical protein  45.04 
 
 
128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147372  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3225  nitrogen fixation-related protein  43.4 
 
 
133 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4203  nitrogen fixation-related protein  40 
 
 
146 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4305  nitrogen fixation-related protein  41.82 
 
 
132 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.605655  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1209  hypothetical protein  42.34 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1840  hypothetical protein  43.64 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141385  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1925  hypothetical protein  38.05 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1941  nitrogen fixation-related protein  33.33 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000861237  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1984  nitrogen fixation-related protein  38.32 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50900  nitrogen fixation-related protein  40.54 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464891  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3461  nitrogen fixation-related protein  31.19 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2642  nitrogen fixation-related protein  31.19 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2133  hypothetical protein  34.26 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577945 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0199  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.13 
 
 
118 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0395191  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2385  hypothetical protein  35.16 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127314  normal  0.230216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>