21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2038 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2038  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  295  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.410974  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4545  hypothetical protein  64.96 
 
 
142 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3498  hypothetical protein  64.12 
 
 
130 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.828835  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2455  hypothetical protein  65.15 
 
 
130 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.91939  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1872  hypothetical protein  61.83 
 
 
130 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.796708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1474  hypothetical protein  61.07 
 
 
130 aa  164  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2036  hypothetical protein  45.31 
 
 
128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147372  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3225  nitrogen fixation-related protein  48.08 
 
 
133 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4203  nitrogen fixation-related protein  43.22 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4305  nitrogen fixation-related protein  43.52 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.605655  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1209  hypothetical protein  42.59 
 
 
130 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1925  hypothetical protein  39.64 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1840  hypothetical protein  40.74 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141385  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1984  nitrogen fixation-related protein  38.1 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50900  nitrogen fixation-related protein  39.45 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464891  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0199  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.77 
 
 
118 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0395191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2133  hypothetical protein  31.25 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2385  hypothetical protein  43.08 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127314  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3461  nitrogen fixation-related protein  28.04 
 
 
121 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2642  nitrogen fixation-related protein  28.04 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1941  nitrogen fixation-related protein  27.1 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000861237  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>