21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1474 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1474  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  262  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2455  hypothetical protein  68.46 
 
 
130 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.91939  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4545  hypothetical protein  66.92 
 
 
142 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1872  hypothetical protein  67.69 
 
 
130 aa  189  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.796708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3498  hypothetical protein  65.38 
 
 
130 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.828835  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2038  hypothetical protein  61.07 
 
 
143 aa  164  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.410974  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2036  hypothetical protein  48.48 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147372  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4203  nitrogen fixation-related protein  45.45 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4305  nitrogen fixation-related protein  45.45 
 
 
132 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.605655  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1984  nitrogen fixation-related protein  43.75 
 
 
119 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3225  nitrogen fixation-related protein  44.25 
 
 
133 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1209  hypothetical protein  44.55 
 
 
130 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1925  hypothetical protein  40.71 
 
 
153 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1840  hypothetical protein  42.71 
 
 
121 aa  84.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141385  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50900  nitrogen fixation-related protein  41.44 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464891  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0199  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.79 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0395191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2133  hypothetical protein  38.18 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1941  nitrogen fixation-related protein  30.36 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000861237  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2642  nitrogen fixation-related protein  31.19 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3461  nitrogen fixation-related protein  31.19 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2385  hypothetical protein  34.33 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127314  normal  0.230216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>