21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1925 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1925  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3225  nitrogen fixation-related protein  69.11 
 
 		 133 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4305  nitrogen fixation-related protein  64 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.605655  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1209  hypothetical protein  60.32 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4203  nitrogen fixation-related protein  60.8 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1840  hypothetical protein  66.36 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141385  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2385  hypothetical protein  77.33 
 
 		 89 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127314  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2036  hypothetical protein  48.7 
 
 		 128 aa  97.8  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147372  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0199  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  47.75 
 
 		 118 aa  96.7  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0395191  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1984  nitrogen fixation-related protein  44.17 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1474  hypothetical protein  40.71 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3498  hypothetical protein  38.79 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.828835  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4545  hypothetical protein  40.71 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2455  hypothetical protein  39.82 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.91939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2038  hypothetical protein  39.64 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.410974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1872  hypothetical protein  38.05 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.796708 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50900  nitrogen fixation-related protein  40.91 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464891  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2133  hypothetical protein  33.06 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1941  nitrogen fixation-related protein  36.27 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000861237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2642  nitrogen fixation-related protein  31.19 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3461  nitrogen fixation-related protein  31.19 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>