21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3498 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3498  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.828835  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2455  hypothetical protein  85.38 
 
 		 130 aa  233  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.91939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4545  hypothetical protein  77.69 
 
 		 142 aa  223  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1872  hypothetical protein  70.77 
 
 		 130 aa  196  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.796708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1474  hypothetical protein  65.38 
 
 		 130 aa  188  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2038  hypothetical protein  64.12 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.410974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2036  hypothetical protein  43.18 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147372  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3225  nitrogen fixation-related protein  44.04 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4203  nitrogen fixation-related protein  40.91 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1209  hypothetical protein  42.73 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4305  nitrogen fixation-related protein  40.91 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.605655  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1840  hypothetical protein  43.75 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141385  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1925  hypothetical protein  38.79 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1984  nitrogen fixation-related protein  38.32 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1941  nitrogen fixation-related protein  33.88 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000861237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3461  nitrogen fixation-related protein  32.17 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50900  nitrogen fixation-related protein  34.78 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464891  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2642  nitrogen fixation-related protein  32.17 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0199  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.3 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0395191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2133  hypothetical protein  31.58 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2385  hypothetical protein  39.44 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127314  normal  0.230216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>