29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1941 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1941  nitrogen fixation-related protein  100 
 
 
121 aa  252  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000861237  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4203  nitrogen fixation-related protein  42.11 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4305  nitrogen fixation-related protein  40.35 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.605655  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3225  nitrogen fixation-related protein  41.51 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1209  hypothetical protein  39.09 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1840  hypothetical protein  43.62 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141385  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1872  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.796708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3498  hypothetical protein  33.88 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.828835  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1984  nitrogen fixation-related protein  34.23 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1474  hypothetical protein  30.36 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0199  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  38.24 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0395191  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1925  hypothetical protein  36.27 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2455  hypothetical protein  30.83 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.91939  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4545  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2036  hypothetical protein  35.04 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147372  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2133  hypothetical protein  39.42 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3461  nitrogen fixation-related protein  38.61 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2642  nitrogen fixation-related protein  38.61 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0534  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.53 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50900  nitrogen fixation-related protein  31.86 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464891  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1397  nitrogenase iron-molybdenum cofactor maturation domain protein family  28.33 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0681076  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1532  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  27.5 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000412529  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2385  hypothetical protein  41.1 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127314  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2420  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.43 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1986  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.08 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0628  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29 
 
 
419 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2038  hypothetical protein  27.1 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.410974  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3017  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.52 
 
 
439 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000106278  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2159  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  26.17 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>